目的:本課題通過篩選肺結(jié)核病患者與對照人群全血樣本之間差異表達的circRNA及mRNA并在人群中進行大樣本的驗證,確定相關(guān)生物標志物,并且通過結(jié)合miRNA的篩查及驗證以期在分子水平解釋結(jié)核感染的機制。方法:收集新疆地區(qū)肺結(jié)核患者3例及對照組3例全血標本,利用全轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)進行測序,獲得circRNA表達譜及mRNA表達譜。根據(jù)P值以及FC值初步確定候選基因;收集新疆地區(qū)肺結(jié)核病患者83例,同時期收集同地區(qū)健康對照者90例,進行RT-qPCR驗證;并且分析40例其他肺部疾病患者差異基因的表達量,以分析其與研究組的相關(guān)性。接著利用miRNA芯片將差異circRNA與mRNA結(jié)果進行關(guān)聯(lián),以期找到與結(jié)核感染有關(guān)的基因及通路。結(jié)果:1)全轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示差異表達的circRNA 835個,其中249個表達上調(diào),586個表達下調(diào)。差異mRNA1218個,其中430個上調(diào),788個下調(diào);miRNA芯片篩選,其中上調(diào)的有76個,下調(diào)的miRNA有92個;2)對差異mRNA進行GO、Pathway富集分析;3)對篩選出的4個有顯著差異的circRNA進行RT-qPCR驗證,結(jié)果表明肺結(jié)核組中h...

【文章頁數(shù)】：85 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
前言
研究內(nèi)容與方法
    1 研究對象
        1.1 病例組納入和排除標準
        1.2 健康對照組納入和排除標準
        1.3 其他肺部疾病組納入排除標準
    2 內(nèi)容與方法
        2.1 實驗主要試劑
        2.2 實驗主要儀器
        2.3 實驗方法
        2.4 實驗原理
    3 質(zhì)量控制
        3.1 數(shù)據(jù)錄入的質(zhì)量控制
        3.2 芯片檢測的質(zhì)量控制
        3.3 RNA檢測的質(zhì)量控制
        3.4 逆轉(zhuǎn)錄過程的質(zhì)量控制
        3.5 PCR反應(yīng)的質(zhì)量控制
    4 統(tǒng)計方法
        4.1 差異基因功能分析統(tǒng)計方法
        4.2 信號通路富集分析方法
        4.3 RT-qPCR數(shù)據(jù)分析方法
        4.4 ROC曲線的繪制
結(jié)果
討論
小結(jié)
致謝
參考文獻
附錄
綜述
    參考文獻
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
導(dǎo)師評閱表



本文編號：3746433