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云南省鼠疫耶爾森菌多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復序列和差異片段的基因分型及其流行病學意義

發(fā)布時間:2021-12-29 23:29
  [目的]利用MLVA和DFR基因分型技術(shù)對云南省分離的鼠疫菌株進行基因分型,探究云南各型鼠疫菌菌株之間的內(nèi)在聯(lián)系、遺傳特征、流行特征及疫源地之間的聯(lián)系,為云南省鼠疫的防控工作提供依據(jù)。[材料與方法]MLVA分型:1.菌株選擇選擇分離自不同地點、不同年代、不同來源的云南鼠疫菌株158株,其中家鼠鼠疫菌株135株、野鼠鼠疫菌株16株、麗江玉龍菌株7株,另外還有1株EV菌。2. VNTR位點選擇VNTR位點是根據(jù)已公布的13株鼠疫菌全基因比對,篩選了14個VNTR位點,其中12個位點是全新的位點,另兩個是已公布使用過的位點。3. DNA的提取利用QIAGEN細菌DNA提取試劑盒進行提取制備。4. PCR擴增和毛細管電泳采用25l的多重PCR反應體系進行擴增,將產(chǎn)物進行毛細管電泳分析,通過PCR產(chǎn)物大小計算出重復數(shù),最后結(jié)果以Excel形式保存。5.結(jié)果分析通過BioNumerics軟件進行數(shù)據(jù)處理,得到各位點的分辨指數(shù),繪制聚類圖和最小生成樹。DFR分型:1.菌株選擇選擇分離自不同地點、不同年代、不同來源的云南鼠疫菌株171株,其中家鼠鼠疫菌株148株、野鼠鼠疫菌株16株、麗江玉龍菌株7株。... 

【文章來源】:大理大學云南省

【文章頁數(shù)】:41 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
縮略語表
摘要
Abstract
前言
    1、中國鼠疫流行概述
    2、云南鼠疫流行概述
    3、鼠疫菌分型及基因組多態(tài)性研究進展
    4、本研究內(nèi)容和意義
基于串聯(lián)重復序列的云南省鼠疫菌基因多態(tài)性研究
    1、導論
    2、材料與方法
    3、結(jié)果
    4、討論
基于差異片段云南省鼠疫菌基因組多態(tài)性研究
    1、導論
    2、材料與方法
    3、結(jié)果
    4、討論
總結(jié)
參考文獻
附錄
綜述
    參考文獻
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]鼠疫疫苗株脈沖場凝膠電泳操作規(guī)范的建立[J]. 石麗媛,王鵬,葉蕊,張蓉.  中國地方病防治雜志. 2012(03)
[2]1999~2008年云南省重要自然疫源性疾病疫情分析[J]. 欒玉泉,楊春光,張再興,董興齊.  中國血吸蟲病防治雜志. 2009(04)
[3]云南省玉龍縣鼠疫菌的生化特性[J]. 郭英,張麗云,夏連續(xù),張志凱,蔡虹,馬鳳琴,張建華,海榮,宋志忠.  地方病通報. 2008(03)
[4]云南玉龍及古城區(qū)鼠疫自然疫源地判定及初步研究[J]. 宋志忠,夏連續(xù),梁云,郭英,魯亮,王國良,蔡文鳳,張正飛,和映天,張福新,董興齊,于國林,王健,俞東征.  中國地方病防治雜志. 2008(01)
[5]鼠疫耶爾森氏菌基因分型的研究進展[J]. 周樹武,楊進業(yè).  中國熱帶醫(yī)學. 2007(03)
[6]云南省鼠疫菌株脈沖場電泳分析[J]. 王鵬,石麗媛,董興齊,于國林.  醫(yī)學動物防制. 2006(05)
[7]應用抑制削減雜交技術(shù)進行鼠疫耶爾森菌的比較基因組研究[J]. 戴二黑,童宗中,王效義,周冬生,張建國,李蓓,楊俊興,陳澤良,宋亞軍,郭兆彪,王津,楊瑞馥.  中華微生物學和免疫學雜志. 2005(03)
[8]中國鼠疫耶爾森菌的分子生物學特征與遺傳學意義[J]. 海榮,俞東征,魏建春,夏連續(xù),史獻明,張志凱,張恩民.  中華流行病學雜志. 2004(06)
[9]鼠疫耶爾森菌基因組進化與生態(tài)位適應研究[J]. 周冬生,韓延平,宋亞軍,童宗中,裴德翠,戴二黑,張玲,包靜月,李敏,崔百忠,張秀清,王津,郭兆彪,祁芝珍,金麗霞,翟俊輝,杜宗敏,王效義,汪建,黃培堂,楊瑞馥.  解放軍醫(yī)學雜志. 2004(03)
[10]串聯(lián)重復序列及其在鼠疫菌基因分型中的應用[J]. 付秀萍,俞東征,海榮.  中華流行病學雜志. 2004(03)

博士論文
[1]鼠疫耶爾森氏菌基因組多態(tài)性研究及快速鑒定溯源系統(tǒng)的建立[D]. 李艷君.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2009

碩士論文
[1]中國鼠疫耶爾森菌多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復序列分析[D]. 張曉媛.中國疾病預防控制中心 2008



本文編號:3557043

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