目的研究冠狀病毒感染相關(guān)心肌損傷機制并預(yù)測可能有效的治療藥物。方法在基因表達數(shù)據(jù)庫檢索并篩選得到GSE59185數(shù)據(jù)集,根據(jù)不同的亞型分為wt組、ΔE組、Δ3組、Δ5組和對照組。用R語言Limma程序包對各組進行差異表達基因分析,將各組上調(diào)、下調(diào)表達基因分別取交集,作為共同差異表達基因,在DAVID數(shù)據(jù)庫進行基因本體學（GO）和京都基因與基因組百科全書（KEGG）通路富集分析。采用自主研發(fā)的表觀精準治療預(yù)測平臺（EpiMed）進行治療藥物預(yù)測。用STRING數(shù)據(jù)庫對共同差異表達基因構(gòu)建蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)并篩選核心基因。結(jié)果各組差異表達基因分析,共交集上調(diào)基因191個,下調(diào)基因18個,共同差異表達基因共209個。GO富集分析發(fā)現(xiàn),共同差異基因主要富集在病毒反應(yīng)、病毒防御反應(yīng)、Ⅰ型干擾素反應(yīng)、γ干擾素調(diào)節(jié)、γ干擾素介導的信號通路、先天免疫反應(yīng)調(diào)節(jié)等;KEGG通路富集主要與細胞因子與受體相互作用、病毒蛋白與細胞因子和細胞因子受體相互作用、TNF、Toll樣受體、缺氧誘導因子1及白細胞介素17信號通路等有關(guān)。通過EpiMed預(yù)測的藥物主要為白藜蘆醇、利托那韋、維甲酸、連翹、魚腥草等。網(wǎng)絡(luò)分析篩選得... 

【文章來源】：中華老年心腦血管病雜志. 2020,22(05)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

PPI網(wǎng)絡(luò)

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao.  Science China（Life Sciences）. 2020(03)
[2]連翹的化學成分及抗炎活性研究[J]. 夏麗,韓竹箴,田童,周越,谷麗華.  上海中醫(yī)藥雜志. 2019(04)
[3]全反式維甲酸抗支氣管哮喘大鼠氣道炎癥的作用及機制[J]. 金紅芳,方紅,王宏偉.  中華結(jié)核和呼吸雜志. 2004(04)
[4]SARS冠狀病毒對心臟及其傳導系統(tǒng)影響的病理學研究[J]. 周光德,趙景民,王松山,孫艷玲,潘登,楊建法,李文淑,于海麗,張?zhí)┖?  解放軍醫(yī)學雜志. 2004(01)
[5]生物信息學方法優(yōu)化依硫磷酸聯(lián)合方案治療骨髓增生異常綜合征的應(yīng)用研究[J]. 盧學春,楊波,朱宏麗,范輝,李素霞,劉洋,姚善謙.  中華醫(yī)學雜志. 2009 (26)



本文編號：3442781