尖銳濕疣患者環(huán)狀RNA芯片的差異表達(dá)
發(fā)布時(shí)間:2021-08-13 20:15
目的分析尖銳濕疣患者皮損組織環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)芯片的差異表達(dá)。方法采用環(huán)狀RNA微陣列芯片技術(shù)對(duì)4例尖銳濕疣患者和3例正常對(duì)照進(jìn)行circRNA初步研究,挑選出6個(gè)顯著差異表達(dá)的circRNAs,并利用定量實(shí)時(shí)逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果與對(duì)照組相比,尖銳濕疣組患者表達(dá)異常的circRNAs共有378個(gè),其中142個(gè)circRNAs表達(dá)上調(diào),236個(gè)circRNAs表達(dá)下調(diào)(fold change≥1. 5,P <0. 05)。生物學(xué)信息分析顯示差異表達(dá)的circRNA與miRNA有關(guān),下調(diào)表達(dá)的hsacircRNA104121可能通過調(diào)控hsa-miR-143-3p影響上皮細(xì)胞生物學(xué)行為。結(jié)論尖銳濕疣組織存在多個(gè)差異表達(dá)的circRNAs,后者通過與相應(yīng)的miRNA結(jié)合在尖銳濕疣的發(fā)病過程中發(fā)揮重要作用,涉及細(xì)胞增殖、凋亡等多個(gè)方面,值得進(jìn)一步探討。
【文章來源】:中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志. 2020,34(02)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 對(duì)象和標(biāo)本
1.2 微陣列芯片分析
1.3 RNA標(biāo)記和擴(kuò)增
1.4 RT-PCR
1.5 生物信息學(xué)分析
1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
1.7 數(shù)據(jù)挖掘和miRNA反應(yīng)元件的序列分析
2 結(jié)果
2.1 circRNA芯片檢測(cè)結(jié)果
2.2 尖銳濕疣組織circRNA芯片的差異表達(dá)
2.3 circRNA和可能的靶miRNA之間的關(guān)系
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甲型流感病毒感染小鼠肺組織中環(huán)狀RNA的表達(dá)變化及其靶基因功能分析[J]. 謝琿,張歡歡,馬月,俞文英,余陳歡. 國(guó)際流行病學(xué)傳染病學(xué)雜志. 2016 (06)
本文編號(hào):3341070
【文章來源】:中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志. 2020,34(02)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 對(duì)象和標(biāo)本
1.2 微陣列芯片分析
1.3 RNA標(biāo)記和擴(kuò)增
1.4 RT-PCR
1.5 生物信息學(xué)分析
1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
1.7 數(shù)據(jù)挖掘和miRNA反應(yīng)元件的序列分析
2 結(jié)果
2.1 circRNA芯片檢測(cè)結(jié)果
2.2 尖銳濕疣組織circRNA芯片的差異表達(dá)
2.3 circRNA和可能的靶miRNA之間的關(guān)系
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甲型流感病毒感染小鼠肺組織中環(huán)狀RNA的表達(dá)變化及其靶基因功能分析[J]. 謝琿,張歡歡,馬月,俞文英,余陳歡. 國(guó)際流行病學(xué)傳染病學(xué)雜志. 2016 (06)
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