目的圓環(huán)病毒2型（porcine circovirus type 2,PCV2）能否感染人類細胞一直都是一個爭論的話題。本研究通過轉錄組測序（RNA sequencing,RNA-seq）技術分析PCV2感染人源細胞后的差異表達基因及其相關的信號通路、生物學功能,以期為人源細胞對PCV2及其他病毒產生抗病毒效應的研究提供參考。方法用PCV2感染He La細胞,然后進行RNA-seq技術分析,篩選與抗病毒反應相關的差異表達基因（differentially expressed genes,DEGs）,并通過實時定量PCR進一步驗證。結果在感染PCV2的He La細胞中共注釋到15402個Uni Genes,其中有387個DEGs（包括267個上調基因和120個下調基因）。對生物過程類DEGs進行GO富集和KEGG通路分析,發(fā)現(xiàn)富集基因要參與應激反應（97/291 DEGs）和免疫系統(tǒng)過程（80/291 DEGs）,其中最顯著兩條途徑的基因是NOD樣受體信號途徑（21/170 DEGs）和單純皰疹病毒感染途徑（22/170 DEGs）相關差異表達基因。結論 PCV2感染He La細胞之后,... 

【文章來源】：中國比較醫(yī)學雜志. 2020,30(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

PCV2感染與未感染細胞基因差異表達分析

圖1 PCV2感染與未感染細胞基因差異表達分析此外，利用STRING網站分析了與病毒應答相關的DEGs潛在的相互作用網絡。如圖3B所示，24個DEGs在PCV2感染后下調，包括IRF9、IFI44L、DDX58、GBP1、GBP3、IFIT2、IFIT1、IFIT3、IL6、IRF1、IRF7、LGALS9、MX1、MX2、OAS1、OAS2、PLSCR1、DDX60、CCL5、IFIH1(MDA5)、DHX58(LGP2)、ZC3H12 A(MCPIP)、RSAD2和ISG15(圖3B)。

此外，利用STRING網站分析了與病毒應答相關的DEGs潛在的相互作用網絡。如圖3B所示，24個DEGs在PCV2感染后下調，包括IRF9、IFI44L、DDX58、GBP1、GBP3、IFIT2、IFIT1、IFIT3、IL6、IRF1、IRF7、LGALS9、MX1、MX2、OAS1、OAS2、PLSCR1、DDX60、CCL5、IFIH1(MDA5)、DHX58(LGP2)、ZC3H12 A(MCPIP)、RSAD2和ISG15(圖3B)。2.4 實時q PCR對DEGs的確認

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
[1]PCV2對人源細胞系感染的研究及轉錄組分析[D]. 劉曉慧.吉林大學 2019



本文編號：3238973