目的探索獲得性免疫缺陷綜合征（AIDS）患者易感抑郁癥的關(guān)鍵差異表達(dá)基因,為進(jìn)一步研究尋找靶點(diǎn)。方法通過(guò)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載AIDS合并抑郁癥患者和AIDS患者額葉皮層灰質(zhì)細(xì)胞的基因芯片數(shù)據(jù)集GSE17440,利用R語(yǔ)言挖掘差異表達(dá)基因,通過(guò)STRING、metascape等工具進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果挖掘出差異表達(dá)基因71個(gè),其中上調(diào)基因16個(gè),下調(diào)基因55個(gè)。經(jīng)過(guò)不同的富集工具富集,差異表達(dá)基因主要集中于細(xì)胞凋亡通路。構(gòu)建蛋白與蛋白互相作用的網(wǎng)絡(luò)圖顯示,差異表達(dá)基因的表達(dá)產(chǎn)物大部分存在密切的相互作用,AIDS合并抑郁癥患者腦部組織免疫防御反應(yīng)異常激活。結(jié)論通過(guò)對(duì)AIDS合并抑郁癥患者和AIDS患者差異表達(dá)基因的分析,對(duì)其差異基因有了系統(tǒng)的認(rèn)識(shí),針對(duì)關(guān)鍵基因的大樣本研究及網(wǎng)絡(luò)化基因分析是未來(lái)的研究方向。 

【文章來(lái)源】：重慶醫(yī)學(xué). 2020,49(13)

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【部分圖文】：

AIDS合并抑郁癥患者及AIDS患者的差異基因聚類熱圖

通過(guò)在線軟件metascape(http：//metascape.org/）對(duì)AIDS合并抑郁癥患者及AIDS患者的差異基因進(jìn)行富集，其富集結(jié)果見表3，其富集分類熱圖見圖2。圖3 AIDS合并抑郁癥患者及AIDS患者的差異基因表達(dá)產(chǎn)物的相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

AIDS合并抑郁癥患者及AIDS患者的差異基因表達(dá)產(chǎn)物的相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]利培酮的藥物基因組學(xué)和高血壓的分子遺傳學(xué)[D]. 魏之昀.上海交通大學(xué) 2012



本文編號(hào)：3234793