發(fā)布時(shí)間：2021-05-16 23:49

　　人冠狀病毒（Human coronavirus,HCoV）是導(dǎo)致人呼吸道感染的重要病原之一。為了從分子水平上探討嚴(yán)重急性呼吸道感染（Severe acute respiratory infection,SARI）病例中HCoV-OC43的基因特征,本研究應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量（Real-time）PCR方法對(duì)2019年河南省374份SARI病例樣本進(jìn)行HCoV-OC43核酸篩查,并對(duì)核酸檢測(cè)陽(yáng)性樣本進(jìn)行棘突蛋白（Spike,S）、RNA依賴的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase,RdRp）和核衣殼蛋白（Nucleocapsid,N）三個(gè)靶基因擴(kuò)增和序列測(cè)定。結(jié)合從GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)篩選的國(guó)內(nèi)外42條代表序列和本研究所獲得的S、RdRp和N三個(gè)靶基因全長(zhǎng)序列構(gòu)建基因親緣性關(guān)系樹,對(duì)本研究所獲得的HCoV-OC43樣本進(jìn)行基因型別鑒定和基因特征分析,并對(duì)HCoV-OC43重要抗原S蛋白進(jìn)行氨基酸位點(diǎn)變異分析。結(jié)果顯示:在374份SARI病例樣本中共檢測(cè)出15份HCoV-OC43核酸陽(yáng)性樣本（15/374,4.01%）,并在4份臨床樣本中獲得S、RdRp和N基因... 

【文章來(lái)源】：病毒學(xué)報(bào). 2020,36(02)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【文章目錄】：
材料與方法
    1樣本來(lái)源
    2實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)
    3 S、Rd Rp和N三個(gè)靶基因的擴(kuò)增及序列測(cè)定
    4序列拼接與進(jìn)化分析
    5氨基酸位點(diǎn)變異分析
結(jié)果
    1 HCoV-OC43樣本S、RdRp和N靶基因擴(kuò)增
    2 HCoV-OC43基因進(jìn)化分析
    3 S蛋白氨基酸位點(diǎn)變異分析
討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]2013-2015年人冠狀病毒OC43基因型分布特點(diǎn)的研究[J]. 賈寶遷,肖艷,王營(yíng),任麗麗,王健偉.  中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2016 (02)
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[5]人冠狀病毒HCoV-OC43的研究進(jìn)展[J]. 胡琴,譚文杰.  中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2013 (07)

碩士論文
[1]人冠狀病毒OC43分子流行病學(xué)與種系進(jìn)化動(dòng)力學(xué)特征研究[D]. 張?jiān)?北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014



本文編號(hào)：3190645