本文選題：腸道病毒 + 檢測�。� 參考：《現(xiàn)代預防醫(yī)學》2017年14期

【摘要】：目的建立一種可用于腸道病毒的快速檢測和基因分型的一致簡并引物巢式RT-PCR方法。方法根據(jù)genbank發(fā)表的不同腸道屬病毒多聚蛋白氨基酸序列,用CODEHOP在線軟件設計1對腸病毒屬簡并引物,并在該引物的擴增區(qū)域內用Primer 3.0軟件設計了EV71、COXA16和COXA10 3個病毒的特異引物,建立了巢式RT-PCR方法,對其檢測靈敏度、特異性進行了分析,并對27份手足口病患者糞便樣品進行了檢測。結果該方法第1輪簡并引物擴增的靈敏度是17 ng;第2步分型引物擴增的靈敏度是第1步反應的100倍。27份手足口病患者糞便樣品RT-PCR檢測結果為陽性,其中15份樣品經(jīng)檢測為EV71病毒陽性,10份樣品經(jīng)COXA16病毒陽性,2份樣品經(jīng)檢測為COXA10病毒陽性。結論建立的一致簡并引物巢式RT-PCR檢測方法具有特異強、靈敏高的優(yōu)勢,可用于腸道病毒的檢測和基因分型。
[Abstract]:Objective to establish a uniform degenerate primer nested RT-PCR method for the rapid detection and genotyping of enterovirus. Method based on the sequence of different enterovirus polyprotein amino acids published by GenBank, 1 pairs of degenerate primers were designed by CODEHOP online software, and the Primer 3 software was set up in the amplification area of the primer. With the specific primers of 3 viruses of EV71, COXA16 and COXA10, the nested RT-PCR method was established. The sensitivity and specificity of the detection were analyzed, and the fecal samples of 27 hand foot and mouth disease patients were detected. The results showed that the sensitivity of the first wheeled primer amplification was 17 ng, and the sensitivity of the second step primer amplification was first step reaction. The results of RT-PCR detection in the stool samples of 100 times.27 HFMD patients were positive, of which 15 samples were detected as EV71 virus positive, 10 samples were COXA16 virus positive and 2 samples were detected as COXA10 virus positive. Conclusion the consistent degenerate primer nested RT-PCR detection method has a strong and sensitive advantage, which can be used in the intestines. Detection and genotyping of the virus.
【作者單位】： 大榭出入境檢驗檢疫局;
【基金】：國家質檢總局科技項目(2016IK179)
【分類號】：R440;R512.5

【參考文獻】

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【共引文獻】

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本文編號：2100104