本文選題：甲流病毒 + 突變度　； 參考：《江南大學》2017年碩士論文

【摘要】：甲型流感(甲流)病毒容易受到外部環(huán)境或其它影響而產生突變,突變后的病毒容易感染人類,并且能夠人傳人。因此,一般每隔幾年有一次甲流爆發(fā),每隔十幾年左右有一次甲流大爆發(fā)。從20世紀開始,總共有四次大型流感。其中1918年爆發(fā)了范圍最廣、影響力最大的“西班牙流感”,全世界約有10億人感染了流感,其中大概有4000萬人死亡。因此,甲流病毒早期預警的研究是至關重要的,而利用生物信息學方法研究它是非常好的一種手段。本文以甲流病毒蛋白質序列作為研究對象,構建突變度模型,利用蛋白質之間特征信息構建甲流病毒蛋白質動態(tài)網(wǎng)絡,為甲流爆發(fā)提供有效的預警信號。主要工作如下:(1)本文選取了1916年至2014年報道的甲流病毒HA蛋白質序列,個別年份數(shù)據(jù)缺失除外。首先將s-1年的甲流病毒HA蛋白質序列中每個對應的氨基酸依次對比,取出它們出現(xiàn)次數(shù)最多的氨基酸,按順序依次排列形成一個新的序列。其次,將s年的甲流病毒HA蛋白質序列與形成的序列比對,計算出每年HA蛋白質的標準差。最后算出每年它的突變度。當突變度值比較大時,s年甲流病毒HA蛋白質相對于s-1年變化比較大,即突變率比較高。因此,可以通過觀察突變度值的變化,就能直觀的發(fā)現(xiàn)甲流病毒HA蛋白質的突變情況。(2)基于上述方法,選取了1933年到2015年甲型流感病毒十種蛋白質氨基酸序列,除有個別年份有部分蛋白質數(shù)據(jù)缺失外,計算出每年甲型流感病毒蛋白質的標準差、算術平均值和變異系數(shù)。通過分別計算出甲流病毒二十種氨基酸的頻率,構建出十種蛋白質序列的23種特征信息。定義了每年十種蛋白質動態(tài)網(wǎng)絡生物標志物的核心蛋白質,分別計算出核心蛋白質之間的特征距離和非核心蛋白質與核心蛋白質之間的特征距離。因此,利用生物標志物之間的相關性構建出一個甲流病毒網(wǎng)絡。這個網(wǎng)絡呈現(xiàn)出動態(tài)性,再結合甲流病毒蛋白質動態(tài)網(wǎng)絡生物標志物的性質,得到一個復合指標Ⅰ。發(fā)現(xiàn)當甲流病毒接近爆發(fā)前的臨界狀態(tài)或者爆發(fā)狀態(tài),復合指標Ⅰ能夠提供一種可靠的、顯著的信息來預測甲流病毒臨界爆發(fā)期或者爆發(fā)期。說明在甲流病毒蛋白質網(wǎng)絡層面上考慮系統(tǒng)動態(tài)網(wǎng)絡生物標志物,可以更穩(wěn)定、更準確地判斷出甲流病毒所處的狀態(tài)。通過構建突變度模型,利用蛋白質之間特征信息構建甲流病毒蛋白質動態(tài)網(wǎng)絡,為預測甲流爆發(fā)可能性提供一個有效的預警信號。這對甲流病毒的研究和預警有著重要的意義。
[Abstract]:A novel influenza A virus ( Influenza A ) virus ( H1N1 ) virus ( H1N1 ) protein sequence has been developed in the past few years .

【學位授予單位】：江南大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：R511.7

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 ;宣布全球度過甲流疫情高峰期還為時過早[J];醫(yī)學研究雜志;2010年01期

2 ;面對“甲流”莫要驚慌[J];僑園;2009年12期

3 楊麗萍;;應對甲流過春節(jié)[J];中華養(yǎng)生保健;2010年02期

4 三三;;甲流來襲怎么辦[J];少年月刊;2010年Z2期

5 張雅婷;;防控甲流 守護健康[J];班主任之友(小學版);2010年01期

6 秋靜;;甲流來了,我也趕了一回“流行”[J];健康管理;2010年01期

7 毛家瑩;;禍不單行“甲流”來襲[J];中國報道;2009年06期

8 張文燕;;美醫(yī)院限訪甲流患者惹爭議[J];中國醫(yī)院院長;2009年22期

9 ;正確洗手 預防甲流——2009年世界洗手日主題活動在京舉辦[J];中國健康教育;2009年11期

10 《中國經濟周刊》特約評論員;;甲流防控如何做到松緊適度[J];中國經濟周刊;2009年43期

相關會議論文 前4條

1 郭力恒;張敏州;韓云;鄒旭;顏芳;;中西醫(yī)結合治療甲流危重癥一例[A];首屆全國中西醫(yī)結合重癥醫(yī)學學術會議暨中國中西醫(yī)結合學會重癥醫(yī)學專業(yè)委員會成立大會論文匯編[C];2010年

2 王卉;;重癥甲流(H1N1)肺炎的影像學表現(xiàn)[A];2010中華醫(yī)學會影像技術分會第十八次全國學術大會論文集[C];2010年

3 付亞平;;中藥治療甲型H1N1流感療效的回顧分析[A];2011年甘肅省中醫(yī)藥學會學術年會論文集[C];2011年

4 楊根東;陸普選;鄧瑩瑩;曹義;鄭斐群;彭程;張莉萍;李苑;葉如馨;;甲型H1N1流感肺炎的臨床CT分型及表現(xiàn)[A];全國第3屆中西醫(yī)結合傳染病學術會議暨中國中西醫(yī)結合學會傳染病專業(yè)委員會第2屆委員會議論文匯編[C];2010年

相關重要報紙文章 前10條

1 記者 韓雪;“中醫(yī)藥防治甲流高層論壇”舉行[N];黑龍江日報;2009年

2 本報記者 李穎;狗染甲流會不會讓疫情更瘋狂？[N];科技日報;2009年

3 德國安聯(lián)保險公司區(qū)域經理/注冊保險師 高凌杰;德國推出甲流保險[N];中國保險報;2009年

4 蔡惠君;甲流專項保險產品遇冷[N];東莞日報;2009年

5 金怡怡;甲流險推出半年遇冷[N];江陰日報;2009年

6 記者 何雪華　徐靜 謝綺珊 黃佩 李立志 任珊珊 盧文潔 通訊員 方瑋 劉沛誠;開學頭件事：嚴防甲流[N];廣州日報;2009年

7 本報特約記者 邰文欣;島內甲流疫情不斷擴大[N];人民日報海外版;2009年

8 記者 徐靜　通訊員 卓越;廣工兩學生確診染甲流[N];廣州日報;2009年

9 記者 黃茜　伍仞 通訊員 粵教宣;甲流病例集中學校可以停課[N];廣州日報;2009年

10 記者 鄭俊彥;我市甲流疫情防疫進入社區(qū)防疫階段[N];東莞日報;2009年

相關博士學位論文 前1條

1 林錦彥;新型甲型H1N1流感分子流行特征、超額死亡及免疫預防策略研究[D];南方醫(yī)科大學;2014年

相關碩士學位論文 前5條

1 汪康;基于蛋白質特征信息的甲流疫情早期預警模型[D];江南大學;2017年

2 周婕;《人民日報》“非典”與“甲流”報道比較研究[D];湖南大學;2014年

3 朱婧;重癥甲流患者外周血TBNK淋巴細胞亞群變化及臨床意義[D];重慶醫(yī)科大學;2010年

4 章文麗;國內SARS和甲流疫情的危機管理政策比較研究[D];上海交通大學;2010年

5 董少鳳;東營市農村居民對甲型H1N1流感的認知調查及影響因素分析[D];山東大學;2010年

，

本文編號：1858531