本文選題：鉤端螺旋體 + 黃疸出血群�。� 參考：《中國人獸共患病學(xué)報(bào)》2015年05期

【摘要】：目的初步探討MLST(multilocus sequence typing)分型技術(shù)在致病性鉤端螺旋體中的應(yīng)用。方法對我國3個(gè)省份的39株致病性鉤端螺旋體黃疸出血群菌株提取DNA,采用7個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行PCR擴(kuò)增、序列測定,應(yīng)用eBURST和BioNumerics(Version5.10)軟件進(jìn)行分析。結(jié)果 39株菌株呈現(xiàn)5個(gè)ST型別,ST1為中國三省份中主要的基因型,占53.85%(21/39)。eBURST分析顯示:39株菌株分為2個(gè)Clonal complexes和1個(gè)singleton,其中Group1占66.67%(26/39),Group2占20.51%(8/39),一個(gè)singleton占12.82%(5/39);BioNumerics軟件聚類分析顯示:39株菌株分為3個(gè)Group,與eBURST分析中的分群結(jié)構(gòu)一致。MLST基因型別具有明顯的地域性特征。結(jié)論 MLST方法可初步應(yīng)用于致病性鉤端螺旋體分子流行病學(xué)、種群結(jié)構(gòu)、親緣進(jìn)化關(guān)系等研究。
[Abstract]:Objective to explore the application of MLST(multilocus sequence typing technique in pathogenic leptospirosis. Methods 39 strains of pathogenic leptospirosis haemorrhage group were extracted from 39 strains from three provinces of China. PCR amplification was performed at 7 loci and sequence was sequenced. EBURST and BioNumericsm Version5.10 software were used to analyze the results. Results 39 strains showed 5 ST-type ST1 genotypes, which were the main genotypes in three provinces of China. The results of 53.85%(21/39).eBURST analysis showed that 39 strains were divided into 2 Clonal complexes and 1 singleton, of which Group1 accounted for 66. 67%, Group1 accounted for 26 / 39%, accounted for 20.51%, and one singleton accounted for 12. 82%. BioNumerics cluster analysis showed that 9 strains were divided into 3 groups, which were consistent with the cluster structure in eBURST analysis. MLST genotypes had obvious regional characteristics. Conclusion MLST method can be applied to the study of molecular epidemiology, population structure and phylogenetic relationship of pathogenic leptospira.
【作者單位】： 中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;江西省疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：國家科技重大專項(xiàng)(2012ZX10004-215,2013ZX10004-101) 國家自然科學(xué)基金(81471968)聯(lián)合資助~~
【分類號】：R514.4

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：1794486