中國(guó)多中心侵襲性酵母菌感染臨床相關(guān)科學(xué)研究方法體系的探索和建立
本文選題:侵襲性真菌病 切入點(diǎn):酵母菌 出處:《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》2017年博士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:[目的]分析中國(guó)醫(yī)院侵襲性真菌監(jiān)測(cè)網(wǎng)CHIF-NET2010-2014連續(xù)五年收集的侵襲性真菌感染分離的酵母菌的流行病學(xué)及抗真菌藥物敏感性,探索并完善真菌鑒定方法、藥敏方法、分子分型方法,耐藥機(jī)制研究,罕見(jiàn)真菌感染病例等相關(guān)模式研究,從而初步構(gòu)建一套關(guān)于臨床重要真菌相關(guān)的科學(xué)研究方法體系。[方法]CHIF-NET 2010-2014五年參加單位共65家,所有收集的菌株在中心實(shí)驗(yàn)室統(tǒng)一使用分子生物學(xué)方法鑒定到種,使用紙片擴(kuò)散法測(cè)定對(duì)氟康唑、伏立康唑的藥物敏感性;對(duì) Vitek MALDI-TOF MS 和 Bruker Biotyper MALDI-TOF MS 兩套質(zhì)譜系統(tǒng)進(jìn)行評(píng)價(jià)研究;以羅倫隱球菌為例評(píng)價(jià)傳統(tǒng)酵母菌鑒定方法Vitek 2 Compact真菌鑒定卡和API 20CAUX試劑條的鑒定準(zhǔn)確性;以微量肉湯稀釋法為金標(biāo)準(zhǔn)評(píng)價(jià)商品化真菌藥敏試驗(yàn)試劑盒ATB(?)FUNGUS 3的性能;以隱球菌為例研究ITS分型、MLST等分子分型技術(shù)的鑒別能力;以季也蒙念珠菌為例,研究ERG11基因與唑類耐藥的關(guān)系;以橡樹(shù)念珠菌為例,對(duì)罕見(jiàn)真菌感染病例的臨床特點(diǎn)進(jìn)行首次報(bào)道。[結(jié)果]CHIF-NET 2010-2014收集的9673株菌株共包含70個(gè)菌種,與分子鑒定結(jié)果相比,原始鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確率為85.9%。在所有菌種中,念珠菌屬最為常見(jiàn)(構(gòu)成比占91.3%),其次為隱球菌屬(6.8%)、毛孢子菌屬(0.8%)和其他少見(jiàn)菌屬(1.2%)。在念珠菌屬中,白念珠菌仍是最常見(jiàn)的菌種(44.9%),非白念珠菌的比例超過(guò)了 50%。Vitek MS v2.0能將96.7%的菌株正確鑒定至種水平;而B(niǎo)ruker Biotyper MALDI-TOF MS鑒定酵母菌的準(zhǔn)確率可達(dá)98.8%,特別是念珠菌屬的鑒定能力更優(yōu)(準(zhǔn)確率達(dá)99.4%)。根據(jù)紙片法藥敏結(jié)果,念珠菌屬對(duì)氟康唑和伏立康唑總體耐藥率為8.8%和3.8%,白念珠菌最為敏感,耐藥率不到1%;近平滑念珠菌復(fù)合體敏感性也相對(duì)較高,達(dá)90.8%和97.5%;光滑念珠菌對(duì)氟康唑和伏立康唑的耐藥率(或非野生型)分別為19.0%和18.7%,而熱帶念珠菌對(duì)兩種藥物的耐藥率五年間上升較為明顯,從5%左右均上升到20%以上。Vitek 2 Compact系統(tǒng)鑒定26株菌為羅倫隱球菌,通過(guò)ITS測(cè)序僅確認(rèn)兩株(7.7%)為羅倫隱球菌,API 20C系統(tǒng)表現(xiàn)出相對(duì)更好的鑒定準(zhǔn)確度(83.3%)。對(duì)于氟康唑和伏立康唑,ATB(?)FUNGUS 3肉眼判讀和微量肉湯稀釋法的總分類一致率(CA)分別是95.5%和95.4%,相比之下,ATB全自動(dòng)儀器判讀的準(zhǔn)確性明顯下降,對(duì)氟康唑和伏立康唑的總CA分別為77.2%和73.3%。MLST分型可將303株菌新型隱球菌分為12個(gè)ST型別,89.8%為ST5型,ST31型是第二大型別;7株格特隱球菌基因變異較大,分為5個(gè)ST型別。對(duì)164株季也蒙念珠菌的ERG11基因進(jìn)行擴(kuò)增和測(cè)序,通過(guò)比較氨基酸序列型的多態(tài)性,共鑒定出16個(gè)基因型,其中一些型別與唑類藥物敏感性密切相關(guān)。對(duì)氟康唑耐藥的橡樹(shù)念珠菌(C.quercitrusa)作為人類致病菌進(jìn)行了首次報(bào)道,并確認(rèn)這3例菌株是來(lái)自H1醫(yī)院ICU病房的院內(nèi)感染暴發(fā)。[結(jié)論]CHIF-NET2010-2014五年連續(xù)監(jiān)測(cè)積累了大量珍貴的菌株及臨床信息資源。本項(xiàng)研究是國(guó)內(nèi)真菌領(lǐng)域內(nèi)時(shí)間跨度最大、參與醫(yī)院最多、涉及菌株數(shù)量最多的流行病學(xué)和藥物敏感性研究,填補(bǔ)了國(guó)內(nèi)相關(guān)領(lǐng)域的空白,為中國(guó)侵襲性真菌感染診治提供重要參考。初步搭建了國(guó)內(nèi)關(guān)于真菌鑒定方法、藥敏方法、分子分型方法、耐藥機(jī)制研究、罕見(jiàn)感染病例報(bào)道等臨床重要真菌相關(guān)的科學(xué)研究方法體系,但該體系的成熟與完善仍任重而道遠(yuǎn)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R519;R446.5
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,本文編號(hào):1641682
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