本文選題：艾滋病病毒Ⅰ型　切入點：輔助受體　出處：《中國艾滋病性病》2015年05期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的了解廣東省艾滋病病毒(HIV)主要流行亞型及V3環(huán)氨基酸的變異特點,并分析病毒株利用輔助受體的情況。方法收集2013-2014年期間,在廣州市第八人民醫(yī)院住院的艾滋病(AIDS)病人的血漿256份,巢式聚合酶鏈反應(Nested-PCR)方法擴增env基因C2-C3(HBX2:6972~7365)區(qū)并直接測序,用Geen tool軟件將基因序列翻譯為氨基酸序列進行比對和分析。結果共有214例(83.6%)擴增成功,其中143例(66.8%)為CRF01_AE;45例(21.0%)為B/C重組型;26例(12.1%)為CRF01_AE/B亞型。V3環(huán)頂端四肽基序,73.4%(157/214)為GPGQ,11.7%(25/214)為GPGR,8.9%(19/214)為GPGK,2.3%(5/214)為GQGQ,其他為(GPGG、GLGH、GPGS、GPGH)3.7%(8/214)。使用國際上普遍應用的4種軟件(PSSMx4r5、SAAC+BLAS、PSSMsisi、Geno2pheno)分別對V3環(huán)頂端四肽基序利用輔助受體的情況進行評估。綜合評估結果顯示,132例(61.7%)利用CCR5,67例(31.3%)利用CXCR4。在15例(7.0%)無輔助受體評估結果的病例中,14例為CRF01_AE,1例為CRF01_AE/B。研究還發(fā)現(xiàn),71.1%(32/45)B/C重組型的V3四肽基序單一使用PSSMsisi軟件的評估結果,與4種軟件綜合評估結果的一致率為100%。結論目前廣東省HIV-1的主要流行株仍是CRF01_AE,其V3環(huán)氨基酸高度變異,頂端四肽基序主要是GPGQ。對毒株利用輔助受體的情況,宜采取國際普遍使用的4種軟件進行綜合分析。
[Abstract]:Objective to investigate the main epidemic subtypes of HIV / HIV in Guangdong Province and the variation characteristics of V3 cyclic amino acids, and to analyze the utilization of coreceptor in the virus strains. A total of 256 plasma samples from patients with HIV / AIDS in Guangzhou 8th people's Hospital were collected and amplified by nested polymerase chain reaction (nested PCR) from HBX2: 6972 (7365) region of env gene, and sequenced directly. The gene sequence was translated into amino acid sequence by Geen tool software for alignment and analysis. Of these, 143 cases (66.8) are CRF01AEG 45 (21.0) (B / C recombination type 26 cases have 12.1g) is CRF01_AE/B subtype .V3 top quadripeptide motif 73.4% 157R 157214) GPGQ 11.7R 11.7R / 214) GPGGR8.9214) is GQGQ = 2.3m5214) GQGQQ, other GGGGG GHGGHGPGHGPGHGPGHGPGH3.7ng / 8214.The use of four internationally popular software PSSMx4rssiphus AC / ASPSSMsisiGeno2o1 / ASPSSMsisiGeno2o) is the apical tip of GQGQQQQQQQQQQQQ, other GQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ (GQGQQQ). The other 26 are GQGQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ. The results of the comprehensive evaluation showed that 132 cases (61.7%) were using CCR567 cases (31.3%) CXCR4. in 15 cases (7.0%) there were 14 cases of CRF01AEN (1 case of CRF01AEEN = CRF01AEP-B). The study also found that the recombinant V3 tetrapeptide group was 71.1% / 32% / 45%. The results of a single use of the PSSMsisi software, Conclusion at present, the main epidemic strain of HIV-1 in Guangdong Province is CRF01AEE, its V3 cyclic amino acid height variation, and the top tetrapeptide motif is mainly GPGQ.Using the auxiliary receptor to the virus strain, the results show that: 1. Four kinds of software which are widely used in the world should be adopted for comprehensive analysis.
【作者單位】： 廣州醫(yī)科大學附屬廣州市第八人民醫(yī)院傳染病研究所;
【基金】：廣東省科技計劃項目(2012B031800336) 十二五國家科技重大專項(2012ZX10001003) 廣州市科技計劃項目(NO2011J4300092)~~
【分類號】：R512.91

【共引文獻】

相關期刊論文 前1條

1 邱方;劉艷紅;米衛(wèi)東;李泱;;基質(zhì)細胞源性因子及其受體在慢性疼痛中的作用[J];解放軍醫(yī)學院學報;2015年04期

相關博士學位論文 前4條

1 韓揚;我國部分地區(qū)HIV/AIDS初治患者的原發(fā)耐藥與亞型流行狀況及特殊患者的療效與耐藥研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2014年

2 羅小峰;德宏州飲酒與艾滋病相關高危行為及病程關系的流行病學研究[D];復旦大學;2013年

3 王妮丹;HIV-1異性傳播關系及傳播病毒序列特征的分析[D];中國疾病預防控制中心;2014年

4 張磊;HIV-1 CRF07_BC嗜性轉(zhuǎn)變研究[D];中國疾病預防控制中心;2014年

相關碩士學位論文 前3條

1 朱靖;河口縣越南籍跨境女性性工作者高危性行為與社會環(huán)境因素的相關性分析[D];昆明醫(yī)科大學;2013年

2 宋亞佩;山東省農(nóng)村外來婦女艾滋病相關行為研究[D];山東大學;2014年

3 楊菲;實驗性中樞中風后疼痛：丘腦核團定位、機制探討及藥物評價[D];第四軍醫(yī)大學;2014年

【二級參考文獻】

相關期刊論文 前1條

1 邵一鳴，趙全壁，王斌，，陳箏，蘇玲，曾毅，趙尚德，張家鵬，段一娟;我國云南德宏地區(qū)HIV感染者HIV毒株膜蛋白基因的序列測定和分析[J];病毒學報;1994年04期

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 譚偉,趙翠萍,李德富;人類免疫缺陷病毒細胞輔助受體的研究進展[J];微生物學免疫學進展;1997年04期

2 賁昆龍,李勁光;作為人艾滋病毒進入細胞的輔助受體的趨化因子受體[J];中國免疫學雜志;1997年04期

3 葉建濤,劉德育;趨化因子及其受體在HIV感染中的作用[J];中藥材;2003年02期

4 石艷春,梁浩,鄭源強;HIV/AIDS致病機理研究進展[J];內(nèi)蒙古醫(yī)學雜志;2005年10期

5 郭彩萍;田亞坤;焦艷梅;易銀;張薇;代麗麗;吳昊;;HAART對HIV輔助受體的影響研究[J];傳染病信息;2011年06期

6 董時軍,王福生,李軍,張海陵,李小燕;T-20抗HIV病毒臨床治療進展[J];中華實驗和臨床病毒學雜志;2003年04期

7 張宏梁;肖宏;;基于Web of Science的HIV感染文獻計量研究[J];第二軍醫(yī)大學學報;2007年05期

8 張少恩;SIV感染受體研究進展[J];國外醫(yī)學.流行病學傳染病學分冊;2003年03期

9 韓保光,馬賢凱;HIV-1 型輔助受體研究進展[J];軍事醫(yī)學科學院院刊;1997年02期

10 羅保君,李敬云,鮑作義,王紅霞,米獻淼;1例HIV-1感染者HIV輔助受體CCR5基因的核酸序列分析[J];中國艾滋病性病;2000年06期

相關會議論文 前5條

1 焦艷梅;吳昊;;研究ART治療對使用不同輔助受體HIV-1病毒的影響[A];中華醫(yī)學會第五次全國艾滋病、病毒性丙型肝炎暨全國熱帶病學術會議論文匯編[C];2011年

2 靳昌忠;姚航平;N Brokmeyaur;吳南屏;;長期HARRT療效與AIDS患者輔助受體表達的關系研究[A];傳染病診治高峰論壇暨2007年浙江省感染病學、肝病學學術年會論文匯編[C];2007年

3 靳昌忠;姚航平;N Brokmevar;吳南屏;;長期HARRT療效與AIDS患者輔助受體表達的關系研究[A];浙江省免疫學會第六次學術研討會論文匯編[C];2007年

4 靳昌忠;姚航平;N Brokmeyar;吳南屏;;長期HARRT療效與AIDS患者輔助受體表達的關系研究[A];2008年浙江省感染病、肝病學術年會論文匯編[C];2008年

5 楊朝國;;C型GB病毒對HIV陽性者的生物學意義[A];第五次全國中青年檢驗醫(yī)學學術會議論文匯編[C];2006年

相關重要報紙文章 前5條

1 黃顯斌 唐明山;我國人群HIV輔助受體基因研究取得進展[N];中國醫(yī)藥報;2004年

2 記者　徐可　通訊員　黃顯斌、唐明山;人群艾滋病毒輔助受體基因研究獲重要進展[N];光明日報;2003年

3 胥金章 黃顯斌;我國HIV基因研究取得進展[N];中國醫(yī)藥報;2003年

4 段文利 呂諾;研究發(fā)現(xiàn):經(jīng)性感染艾滋病毒者發(fā)病更快[N];新華每日電訊;2014年

5 黃顯斌 唐明山;國人艾滋病毒受體基因與白種人不同[N];健康報;2003年

相關博士學位論文 前2條

1 柳葉;阻斷HIV-1輔助受體CXCR4的新方法研究[D];武漢大學;2012年

2 孫堅萍;我國HIV-1主要流行毒株感染者中和免疫和免疫逃逸分析[D];中國疾病預防控制中心;2008年

相關碩士學位論文 前3條

1 陳哲;廣西仫佬、壯和漢三民族HIV輔助受體CCR5基因多態(tài)性研究[D];廣西醫(yī)科大學;2007年

2 譚艷;艾滋病患者抗病毒治療前后T細胞表面某些歸巢分子和輔助受體表達的變化研究[D];南華大學;2010年

3 屈水令;抗病毒治療人群HIV-1輔助受體利用及V3區(qū)基因預測研究[D];中國疾病預防控制中心;2009年

本文編號：1633617