發(fā)布時間：2017-08-20 13:40

  本文關鍵詞：基于全基因組單核苷酸多態(tài)性的遺傳力估計的方法研究

  更多相關文章： 單核苷酸多態(tài)性 線性混合模型 方差分析估計 逐步回歸 遺傳力估計

【摘要】：隨著對基因領域的深入研究和不斷探索,人類對復雜性狀和常見病的研究逐步深入到了全基因組的研究中.而單核苷酸多態(tài)性SNP在這些研究中起到了重要的作用.SNP是可遺傳變異中最常見的一種,并且它廣泛地分布在某些群體、個體全基因組DNA中,大約每1000個堿基出現(xiàn)一個SNP.正是由于SNP的分布廣泛、遺傳相對穩(wěn)定、對基因的表達水平或蛋白質(zhì)結(jié)構有很大影響的性質(zhì),對于全基因組SNP的研究已經(jīng)應用到生物學、遺傳學等諸多領域.一直以來,像糖尿病、高血壓、冠心病等復雜疾病一直困擾著我們.由于99%的人類基因與老鼠非常相似,所以科學家用老鼠的實驗去研究影響復雜疾病的性狀.本文主要對和復雜疾病(糖尿病、高血壓、冠心病)相關的四個性狀進行遺傳力大小的估計,用288只NMRI老鼠的真實性狀表型值和SNP基因型,通過線性混合模型,應用方差分析估計的方法對HDL、CHL、TRI、GLU這四個性狀進行遺傳力估計.并用逐步回歸和次等位基因頻率MAF進一步對染色體和SNP位點篩選.結(jié)果表明,通過逐步回歸和MAF變量篩選,對遺傳力估計結(jié)果的貢獻最大的致病位點的基因頻率范圍和MAF0.1的SNP是一致的.
【關鍵詞】：單核苷酸多態(tài)性 線性混合模型 方差分析估計 逐步回歸 遺傳力估計
【學位授予單位】：黑龍江大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R394
【目錄】：

• 中文摘要3-4
• Abstract4-7
• 符號說明7-8
• 第1章 緒論8-14
• 1.1 背景介紹8-10
• 1.2 國內(nèi)外研究概況10-13
• 1.2.1 國外發(fā)展現(xiàn)狀11
• 1.2.2 國內(nèi)發(fā)展現(xiàn)狀11-12
• 1.2.3 論文研究的目的和意義12-13
• 1.3 本文的創(chuàng)新點13-14
• 第2章 預備知識14-19
• 2.1 遺傳學的相關理論基礎14-16
• 2.1.1 染色體、等位基因、基因型、表型14
• 2.1.2 連鎖不平衡(LD)14-15
• 2.1.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)15-16
• 2.2 遺傳力16-18
• 2.2.1 遺傳方差的定義16-17
• 2.2.2 遺傳力的定義17-18
• 2.3 本章小結(jié)18-19
• 第3章 遺傳力估計的方法19-28
• 3.1 線性混合模型19-23
• 3.1.1 線性混合模型的介紹19-20
• 3.1.2 線性混合模型在遺傳力估計上的應用20-23
• 3.2 方差分析估計23-27
• 3.2.1 矩陣的QR分解24-25
• 3.2.2 方差分析法AN OV A進行遺傳力估計25-27
• 3.3 本章小結(jié)27-28
• 第4章 老鼠的四個性狀的遺傳力估計28-31
• 4.1 數(shù)據(jù)資料28-29
• 4.2 結(jié)果29-30
• 4.3 本章小結(jié)30-31
• 第5章 變量篩選31-39
• 5.1 逐步回歸法篩選變量31-35
• 5.1.1 顯著性檢驗31-32
• 5.1.2 逐步回歸的結(jié)果32-35
• 5.2 最小等位基因(MAF)閾值篩選35-38
• 5.3 本章小結(jié)38-39
• 結(jié)論39-41
• 參考文獻41-46
• 致謝46

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本文編號：706976