本文關鍵詞：基于生物信息學分析微小隱孢子蟲含WD40結構域的蛋白功能

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【摘要】：目的對微小隱孢子蟲中含WD40結構域的蛋白進行生物信息學分析,分析該蛋白家族的WD40結構并預測其功能,為微小隱孢子蟲基因功能的研究提供一定的基礎理論。方法通過隱孢子蟲基因組數(shù)據(jù)庫收集數(shù)據(jù),獲得微小隱孢子蟲含WD40結構域蛋白家族的序列信息,搜索每個蛋白的CDD結構域并進行NCBI BLAST比對分析,確定為WD40結構域家族蛋白,分析結構域并預測功能。結果在C.parvum Iowa II中共搜索到50個含有WD40結構域的蛋白,其中cgd1_1930、cgd5_740和cgd4_3360含有CAF1C_H4-bd超家族結構,可能參與DNA修復和DNA復制過程;cgd4_260含有ACE1-Sec16-like超家族,可能參與囊泡的形成和物質運輸;cgd1_2600含有TAF5_NTD2結構域,可能參與蛋白與蛋白的相互作用。結論在微小隱孢子蟲中,WD40蛋白家族不僅可能單獨發(fā)揮作用,而且還能通過相互輔助、結合發(fā)揮其生物效應。
【作者單位】： 暨南大學醫(yī)學院;
【關鍵詞】： 微小隱孢子蟲 WD結構域 生物信息學分析 功能預測
【基金】：國家自然科學基金(No.30901249,No.81101267) 廣東省自然科學基金(No.10151063201000036,No.S2011010002526) 暨南大學科研培育與創(chuàng)新基金(No.21612426)聯(lián)合資助~~
【分類號】：R382.3
【正文快照】： 隱孢子蟲(Cryptosporidiumspp.)是一種世界范圍內廣泛流行的人獸共患寄生蟲[1],其中感染人的主要為微小隱孢子蟲(Cryptosporidium par-vum)和人隱孢子蟲(Cryptosporidium homi-nis)[2-3]。隱孢子蟲主要寄生在消化道或呼吸道,在免疫功能正常者呈自限性感染;但在免疫功能低下的

【共引文獻】

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