隨著耐藥細菌的大量出現(xiàn)及廣泛傳播,細菌耐藥性成為全球備受關(guān)注的問題。耐藥細菌的特征如耐藥基因、毒力因子、質(zhì)粒分型等以及不同菌株間親緣關(guān)系對于細菌耐藥性流行病學及分子生物學的研究有著十分重要的意義。但是傳統(tǒng)的技術(shù)手段如聚合酶鏈式反應(Polymerase chain reaction,PCR)和脈沖場凝膠電泳(Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)等得到的結(jié)果不夠全面且精確度低,對于現(xiàn)有的研究存在很大的局限性。全基因組測序技術(shù)(Whole genome sequencing,WGS)和生物信息學分析(Bioinformatics analysis)由于能夠快速詳盡地得到耐藥細菌的特征,也能更加精細地判斷不同菌株間的進化關(guān)系,逐漸成為更加有效的技術(shù)手段,為耐藥性研究提供了有效的幫助。因此,文中系統(tǒng)地介紹全基因組測序分析流程中的各個步驟,主要包括文庫構(gòu)建、平臺測序以及后期數(shù)據(jù)分析三大方面的不同方法和其相應的特點,期望相關(guān)研究人員對此能夠有更全面的了解,并得到一定的幫助。

【文章頁數(shù)】：17 頁

【文章目錄】：
1 文庫構(gòu)建
2 測序平臺
3 組裝拼接
4 數(shù)據(jù)分析軟件
5 SNP分析及進化樹構(gòu)建
6 討論
7 展望



本文編號：3919778