定位候選策略是目前發(fā)現(xiàn)疾病基因的主要方法,其關(guān)鍵問題之一是如何對采用連鎖分析等方法定位的疾病區(qū)間中數(shù)以百計的候選基因進行致病風險評估。有效解決這一問題對于縮短疾病基因發(fā)現(xiàn)周期、減少花費等都具有重要意義。越來越多的疾病基因被發(fā)現(xiàn),使得采用計算機方法從已知疾病基因中獲取知識以幫助發(fā)現(xiàn)未知疾病基因成為可能。但是,目前基于表達信息、基因功能以及疾病基因統(tǒng)計特征的三種方法都不能很好地解決這一問題。因為基于表達信息和基因功能的方法的效果嚴重依賴于表達與功能信息的完整性與準確性,而目前基于疾病基因序列特征的方法僅僅考慮所有疾病基因和正�；虻男蛄刑卣髟诮y(tǒng)計水平的差異,沒有對不同的疾病區(qū)別對待。為了更好地解決這一問題,發(fā)現(xiàn)不同疾病的致病基因所特有的序列特征是一種新的途徑。密碼子使用特征因為其蘊涵的豐富的生物學意義而被選作本研究重點挖掘的特征。一種新的方法被用來提取疾病基因中密碼子的使用特征,結(jié)果發(fā)現(xiàn)導致同一種疾病的致病基因的密碼子使用常常表現(xiàn)出疾病特異性,即同種疾病的致病基因之間密碼子使用非常相似,而與其他基因則存在顯著差別�；谶@種疾病特異的密碼子使用特征,設計了一種新的預測疾病基因的方法。對46種... 

【文章來源】：華中科技大學湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：56 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

家族性肥厚型心肌病（圖a）和白內(nèi)障疾病（圖b）的疾病基因中P值小于0.01的密碼子使用頻率與CUTG中相應密碼子平均使用頻率的比較

3．在已定位的 52 個心血管疾病區(qū)間中（涵蓋了 19 種心血管疾�。�，共有 25 個候選新基因落在心血管疾病定位區(qū)間并且可能與該疾病相關(guān)，被認為是一個潛在的候選疾病基因。這些分析結(jié)果已經(jīng)提供了 web 服務（http://infosci.hust.edu.cn/），圖 4.2是 web 服務界面。

心血管疾病相關(guān)新基因數(shù)據(jù)庫結(jié)果顯示界面

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Predicting disease genes for familial dilated cardiomyopathy based on the codon usage bias[J]. ZHOU Yanhong1,2, ZHOU Quanxiong1,2, LIU Huailan1,2 & WAN Honghui3 1. Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China; 2. Hubei Bioinformatics and Molecular Imaging Key Laboratory, Wuhan 430074, China; 3. Laboratory of Bioinformatics, Maryland Institute of Dynamic Ge-nomics, Silver Spring, MD 20906, USA.  Chinese Science Bulletin. 2005(18)
[2]Identification of true EST alignments and exon regions of gene sequences[J]. ZHOU Yanhong, JING Hui, LI Yanen & LIU Huailan Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Tech- nology, Wuhan 430074, China Correspondence should be addressed to Zhou Yanhong.  Chinese Science Bulletin. 2004(23)
[3]多基因遺傳病基因研究的策略和方法[J]. 張奎星,朱鼎良,黃薇.  生理科學進展. 2001(03)
[4]致病基因的定位候選克隆[J]. 沈巖.  生命科學. 1999(05)



本文編號：3347499