目的對分析葡萄球菌基因組中CRISPR-Cas系統(tǒng)基因結構,探討其與細菌耐藥性之間的關系。方法 CRISPRdb數(shù)據(jù)庫中公布的154株及NCBI中下載的171株葡萄球菌基因組共包含20個種,利用生物信息學方法分析CRISPR分布情況、重復序列、間隔序列、cas基因及CRISPR存在與細菌mecA基因之間的關系。結果 325株葡萄球菌基因組中共發(fā)現(xiàn)196個確定的CRISPR結構和1757個可疑的CRISPR結構;有25株含有cas基因簇,可分為Ⅲ-A(占48.1%)和Ⅱ-C(占51.9%)兩型;確定CRISPR陣列中重復序列數(shù)大多數(shù)為2,有14種重復序列可以形成莖環(huán)結構,遺傳進化分析顯示其大致可以分為3類。確定CRISPR陣列中437種間隔序列有53種匹配質(zhì)粒或噬菌體,部分序列同時匹配多個質(zhì)�；蚴删w。cas基因簇存在和不存在時的mecA攜帶率分別為28.00%和54.15%,差異有統(tǒng)計學意義(χ~2=6.37,P0.05),兩者呈負相關。結論葡萄球菌基因組中CRISPR-Cas系統(tǒng)攜帶率低,且基因座、cas基因的結構和功能均不完善,僅較少的菌株中含有完整的CRISPR-Cas系統(tǒng),基因座中可疑結構較多,且DRs和spacer數(shù)量低于其他細菌。完整的葡萄球菌CRISPR-Cas系統(tǒng)可能限制mecA基因的水平轉(zhuǎn)移。
【部分圖文】：

圖１葡萄球菌ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系統(tǒng)結構圖Ｆｉｇ．１ＴｈｅｇｅｎｅｉｃｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓｓｙｓｔｅｍ圖２基于葡萄球菌ｃａｓ１基因構建的系統(tǒng)發(fā)育樹Ｆｉｇ．２ＴｈｅｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｏｆＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓｂａｓｅｏｎｃａｓ１ｓｅｑｕｅｎｃｅ·６５５·中國病原生物學雜志ＪｏｕｒｎａｌｏｆＰａｔｈｏｇｅｎＢｉｏｌｏｇｙ２０１９年５月第１４卷第５期Ｍａｙ．２０１９，Ｖｏｌ．１４，Ｎｏ．５
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