【摘要】：HIV-2蛋白酶已成為治療艾滋病的一個(gè)重要藥物靶標(biāo)。作者采用分子動(dòng)力學(xué)模擬并結(jié)合自由能計(jì)算,研究了抑制劑Amprenavir(AMP)與HIV-2蛋白酶的作用機(jī)制。研究結(jié)果表明范德華作用是AMP與HIV-2蛋白酶結(jié)合的主要力量。采用基于殘基的自由能分解方法計(jì)算抑制劑-殘基相互作用,結(jié)果表明疏水性的CH-π和CH-O相互作用驅(qū)動(dòng)了抑制劑AMP與HIV-2蛋白酶的結(jié)合。作者期望這一研究結(jié)果能為抗艾滋病雙重抑制劑的研發(fā)提供一定的理論指導(dǎo)。
[Abstract]:HIV-2 protease has become an important drug target for the treatment of AIDS. The interaction mechanism of inhibitor Amprenavir (AMP) with HIV-2 protease was studied by molecular dynamics simulation and free energy calculation. The results show that van der Waals interaction is the main force of the binding of AMP and HIV-2 protease. The free energy decomposition method based on residue was used to calculate the depressant residue interaction. The results showed that the interaction of hydrophobic CH- 蟺 and CH-O driven the binding of inhibitor AMP and HIV-2 protease. The authors hope that this study will provide some theoretical guidance for the development of anti-AIDS dual inhibitors.
【作者單位】： 山東交通學(xué)院辦公室;山東交通學(xué)院理學(xué)院;山東師范大學(xué)物理與電子科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(11104164,11274206和31200545) 山東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(ZR2011HM048) 山東交通學(xué)院博士啟動(dòng)資金 校自然基金項(xiàng)目~~
【分類號(hào)】：R341

【參考文獻(xiàn)】

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