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丙肝病毒非結構基因NS5A的克隆表達及其缺失突變體的基因表達譜芯片分析

發(fā)布時間:2018-04-30 20:14

  本文選題:丙型肝炎 + NS5A ; 參考:《鄭州大學》2007年碩士論文


【摘要】: 背景和目的 丙型肝炎病毒(HCV)屬黃病毒科,主要經(jīng)血傳播的肝炎病毒?梢鹇愿窝住⒏斡不案伟,對人類健康危害極大。目前世界上有1.7億人感染。病毒主要感染肝細胞,然而有研究表明丙型肝炎病毒也可能感染其他類型的細胞,比如B細胞,單核巨噬細胞,和樹突狀細胞,從而導致免疫功能異常。了解HCV作用于肝細胞和肝外細胞的分子生物學基礎對揭示丙肝的發(fā)病和慢性化機制非常關鍵。HCV基因組轉錄翻譯為一條多肽前體,,在信號肽酶和蛋白酶的作用下裂解為10個蛋白,包括Core、E1、E2、P7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A、NS5B。NS5A是非結構蛋白的一種(HCV-1b型有447個氨基酸殘基),C-末端絲氨酸被磷酸化后形成基礎磷酸化的NS5A蛋白。在NS4A蛋白依賴的模式下,NS5A蛋白中央的絲氨酸被磷酸化,形成高度磷酸化的NS5A蛋白。NS4A蛋白結合并支配NS5A蛋白的高度磷酸化。盡管NS5A在病毒復制中的作用還未搞清,然而卻發(fā)現(xiàn)NS5A上的一段區(qū)域(氨基酸2209到2248)與干擾素治療的敏感性有關。此區(qū)已命名為干擾素(IFN,interferon)敏感決定區(qū)(ISDR)。對判斷干擾素的療效很有幫助。另一方面,NS5A蛋白可和PKR催化結構域直接相互作用,抑制其活性。在體內(nèi),NS5A蛋白可破壞雙鏈RNA激活的蛋白激酶(double-stranded RNA-activated protein kinase PKR)的二級結構。抑制PKR介導的eIFalpha磷酸化。但NS5A蛋白是否參與了感染細胞抵抗IFN的抗病毒效應仍未明了。研究表明,缺失N-末段129-146氨基酸殘基的NS5A蛋白有較強的反式激活作用。NSSA的轉錄激活區(qū)域包括兩個酸性氨基酸區(qū)(2 143-2 184 2 220-2 273氨基酸殘基)和一個脯氨酸富集區(qū)(2 282-2 327氨基酸殘基),這些區(qū)域被認為是NS5A的轉錄活性區(qū)域。對NS5A進行研究,找出NS5A在肝細胞中的表達對肝細胞基因表達譜產(chǎn)生的影響,并進一步弄清具體作用機制、作用效應及連帶影響,對明確HCV的致病機制,尋找有效防治方法具有重要意義。 方法 1.根據(jù)文獻[6]及NCBI的Genbank上公布的HCV-1b型基因序列,設計PCR產(chǎn)物片段包含NS5A的特異性引物,以從病人血清中提取的以HCV-1b型RNA為模板,,利用RT-PCR方法擴增出1632bp片段,連接至pGEM-T載體并送測序,根據(jù)測序結果設計PCR產(chǎn)物為NS5A的特異性引物,以上述連接至pGEM-T載體1632bp片段為模板擴增出1341bp片段,連接至pGEM-T載體并送測序。2.將上述引入酶切位點EcoRV和HindⅢ的pGEM-T-NS5A和pET32a(+)空質粒經(jīng)EcoRV和HindⅢ雙酶切,酶切片段回收后連接,測序正確后轉化BL21宿主菌,0.5mM/ml IPTG、30℃誘導5hr,3.根據(jù)1的測序結果設計NS5A缺失突變型1特異性引物,引入酶切位點KpnⅠ和HindⅢ,以pGEM-T-NS5A質粒為模板,PCR擴增出591bp片段,插入至真核表達載體pcDNA3。1(-)/myc中,測序完全正確,表明NS5A缺失突變型1真核表達載體的構建成功。4.用3構建的pcDNA3。1/myc-His(-)A-NS5ADM1真核表達重組質粒,與空質粒分別轉染HepG2細胞并獲得表達,兩者互為平行對照,提取轉染后的細胞總RNA,應用基因表達譜芯片技術檢測HepG2在NS5A缺失突變體轉染后差異表達的基因譜的變化。 結果 1.NS5A測序結果和NCBI上NS5A序列比對后,有91.4%的同源性,表明NS5A已克隆成功。2.Western blotting檢測結果顯示我們獲得了帶有組氨酸標簽的重組融合蛋白的優(yōu)化表達。3.NS5A缺失突變型測序結果表明NS5A已克隆成功。4.篩選獲得了3條已知的反式上調(diào)基因,10條已知的反式下調(diào)基因。 結論 1.成功克隆了NS5A基因,NS5A成功表達為今后單抗和多抗的制備奠定了基礎。2.NS5A缺失突變體上調(diào)基因為①.細胞質膜鈣離子轉運ATP酶2;②.引發(fā)酶多肽;③.環(huán)指蛋白185。下調(diào)基因包括①Hbrm基因;②SCL/TAL1阻斷基因座;③核糖核苷二磷酸還原酶M2鏈相似蛋白;④鋅指蛋白253;⑤白介素2增強結合因子(ILF2);⑥U2相關SR40蛋白;⑦神經(jīng)母細胞瘤擴增蛋白;⑧酸性鈣通道;⑨大電導鈣激活鉀通道;⑩ralA結合蛋白1(RALBP1)等。結果提示NS5Adm1與DNA和RNA復制合成過程、離子通道蛋白,腫瘤細胞的形成和細胞凋亡有關。3.上述研究為進一步開展NS5A的生物學活性研究奠定了物質基礎,以及為研究其在體內(nèi)存在的調(diào)控機制提供了線索和依據(jù)。
[Abstract]:Background and Purpose






Hepatitis C virus ( HCV ) is a kind of hepatitis virus which is mainly transmitted by blood and blood . It can cause chronic hepatitis , liver cirrhosis and liver cancer . It is very important to human health . It is suggested that NS5A protein can infect other types of cells , such as B cells , mononuclear phagocytes , and dendritic cells . It is suggested that NS5A protein can infect other types of cells , such as B cells , mononuclear phagocytes and dendritic cells .






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本文編號:1826055

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