本文關鍵詞：大理地區(qū)結核分枝桿菌MIRU-VNTR位點的多態(tài)性分析

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【摘要】：目的了解大理地區(qū)結核分枝桿菌基因組中的數(shù)目可變串聯(lián)重復序列(variable number tandem repeat,VNTR)即MIRU(mycobacterium interspersed repetitive unit)基因多態(tài)性,探討MIRU-VNTR位點多態(tài)性的應用價值。方法采用PCR和瓊脂糖凝膠電泳檢測大理地區(qū)臨床分離的60株結核分枝桿菌7個VNTR位點,采用MIRU-VNTR技術進行分型,利用Hunter-Gaston指數(shù)(HGI)對各MIRU進行分辨力評價,并應用Quantity one軟件和BioNumerics6.6軟件進行數(shù)字化和聚類分析。結果 60株結核分枝桿菌分為5個基因群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ群)52個基因型。Ⅰ群占56.77%,含有29個基因型;Ⅱ群占25.00%,含有13個基因型;Ⅲ群占8.33%,含有5個基因型;Ⅳ群占6.67%,含有3個基因型;Ⅴ群占3.33%,含有2個基因型。7位點組合總分辨力為0.900,最高ETR-E位點0.735,最低ETR-C位點0.455。結論大理地區(qū)分離株結核分枝桿菌存在基因多態(tài)性,7位點MIRU-VNTR分型簡便快速,分辨力高,適合用于大理地區(qū)結核分枝桿菌的基因分型檢測。
【作者單位】： 大理學院基礎醫(yī)學院微生物學與免疫學教研室;
【關鍵詞】： 結核分枝桿菌 基因分型 多位點可變串聯(lián)重復序列 多態(tài)性 Hunter-Gaston指數(shù)
【基金】：國家自然科學基金項目(No.81260456)
【分類號】：R378.911
【正文快照】： ***結核病是全球流行的傳染病之一,是由結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的慢性傳染病,可累及全身各器官。我國是22個結核病高負擔國家之一[1],追蹤傳染源,研究傳播情況是防止我國結核病流行的重要內容。MTB基因組中的可變串聯(lián)重復序列(VNTR)即MIRU(mycobact

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本文編號：1044264