本文關鍵詞：組織中少量細胞的微衛(wèi)星長度精細分析

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【摘要】：微衛(wèi)星是基因組上的特殊短重復序列,微衛(wèi)星不穩(wěn)定的程度與一些腫瘤的分型、治療和預后相關。目前,微衛(wèi)星長度變化的檢測往往是基于大量細胞,檢測靈敏度低。本文整合激光顯微切割技術,基于多次退火環(huán)狀循環(huán)擴增(multiple annealing and looping-based amplification cycles,MALBAC)的單細胞全基因組放大技術和毛細管電泳長度測量方法,經(jīng)過關鍵技術點的改進,建立了一套針對組織中少量細胞的多微衛(wèi)星位點檢測方法。研究結果表明,基于技術改進,HE染色的組織細胞經(jīng)激光顯微切割分選后,可成功用MALBAC技術進行全基因組放大,并在多微衛(wèi)星位點的檢測上,獲得了高度的準確性和重復性。利用所建立的方法,發(fā)現(xiàn)腸型胃癌早期病變組織-腸上皮化生(intestinal metaplasia,IM)的單個腺體內(nèi)部出現(xiàn)多種長度變化的微衛(wèi)星改變,說明該癌前病變組織中DNA錯配修復系統(tǒng)已經(jīng)出現(xiàn)問題。本方法所獲得的全基因組放大產(chǎn)物,也可以用于外顯子組測序和全基因組測序。另外,該方法適用于任何組織的少量細胞,甚至單細胞的多微衛(wèi)星位點檢測,以及全基因組的研究,為精細研究少量病變細胞的基因組特征以及組織異質(zhì)性提供了有效的方法。
【作者單位】： 上海交通大學系統(tǒng)生物醫(yī)學研究院系統(tǒng)生物醫(yī)學教育部重點實驗室;上海交通大學生物醫(yī)學工程學院;上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院上海消化外科研究所;
【關鍵詞】： 基于多次退火環(huán)狀循環(huán)擴增(MALBAC) 全基因組放大 腸上皮化生 微衛(wèi)星 激光顯微切割
【基金】：國家自然科學基金委項目(No.91229108和No.91529302)~~
【分類號】：R363
【正文快照】： 微衛(wèi)星是基因組的特殊短重復序列[1]。正常細胞每次分裂都會出現(xiàn)一定頻率的微衛(wèi)星長度變化,微衛(wèi)星長度的變化通過細胞內(nèi)的DNA錯配修復基因進行修復[2]。在一些病理條件下,由于DNA錯配修復基因存在一定的缺陷,導致出現(xiàn)微衛(wèi)星長度變化[3,4]。如果這些變化存在于基因的編碼區(qū)或者

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2 鄒廣發(fā);徐艷春;;微衛(wèi)星在犬咬傷中的鑒定意義[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學進展;2009年17期

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4 曾華;丁偉斌;趙毅;姚運紅;胡新榮;;放療后復發(fā)鼻咽癌微衛(wèi)星不穩(wěn)定和雜合性缺失改變的研究[J];廣東醫(yī)學院學報;2014年03期

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