調控人骨橋蛋白的miRNA預測研究
發(fā)布時間:2017-09-01 22:35
本文關鍵詞:調控人骨橋蛋白的miRNA預測研究
更多相關文章: 微小RNA 骨橋蛋白 生物信息學 靶基因預測
【摘要】:目的利用生物信息學方法預測調控人骨橋蛋白的微小RNA(miRNA),為進一步實驗驗證特定miRNA和人骨橋蛋白基因之間的關系提供依據(jù)。方法分別應用miRGen Targets和miRanda數(shù)據(jù)庫確定與人骨橋蛋白有密切關系的miRNA分子。結果經(jīng)miRGen Targets數(shù)據(jù)庫預測出28個miRNA分子可能作用于人骨橋蛋白基因;miRanda數(shù)據(jù)庫顯示miR-539,miR-181,miR-340,miR-376c和miR-154 5個miRNAs在人骨橋蛋白的負調控過程可能發(fā)揮作用;將兩個數(shù)據(jù)庫結果交集后發(fā)現(xiàn)miR-539,miR-181,miR-33b和miR-377 4個miRNA分子最有可能參與調控人骨橋蛋白。結論利用生物信息學軟件可對調控人骨橋蛋白的miRNA進行預測,為研究骨橋蛋白的功能和生物學特性提供新手段。
【作者單位】: 包頭醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院神經(jīng)外科;
【關鍵詞】: 微小RNA 骨橋蛋白 生物信息學 靶基因預測
【基金】:國家自然科學基金項目(81360164) 內蒙古自然科學基金項目(2014MS0806)
【分類號】:R3416
【正文快照】: 骨橋蛋白(osteopontin,OPN)是1985年Franzen和Heinegard[1]從小牛長骨分離出來的一種骨基質蛋白。OPN在人體組織細胞中分布廣泛,特別是在骨的活躍沉積和礦化區(qū),且不同階段的成骨細胞均能合成和分泌OPN分子。OPN參與多種生理和病理過程[2]。OPN被認為是成骨細胞成熟分化的標志,
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,本文編號:774831
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