本文關(guān)鍵詞：基于高通量測(cè)序的黑胸大蠊轉(zhuǎn)錄組分析

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【摘要】：目的利用轉(zhuǎn)錄組技術(shù)獲得非模式生物黑胸大蠊的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),為今后開展分子生物學(xué)研究打下基礎(chǔ)。方法利用Illumina測(cè)序技術(shù)對(duì)黑胸大蠊Periplaneta fuliginosa進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。測(cè)序結(jié)果取閾值e≤10~(-10)在SwissProt、NR、KEGG、COG、GO和Pfam等公共序列數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。結(jié)果獲得黑胸大蠊轉(zhuǎn)錄組信息數(shù)據(jù)量13.63 G,39576個(gè)unigene,總長(zhǎng)度32 297 597 bp,最長(zhǎng)27 693 bp,平均長(zhǎng)度816 bp。共獲得61 167個(gè)注釋結(jié)果。發(fā)現(xiàn)黑胸大蠊單核苷酸的多態(tài)性位點(diǎn)(SNP)置換33 955個(gè),顛換16 561個(gè),找到2 666個(gè)微衛(wèi)星序列。結(jié)論數(shù)量巨大的轉(zhuǎn)錄組信息為黑胸大蠊新基因的克隆和基因組學(xué)研究提供了有價(jià)值的信息。
【作者單位】： 浙江出入境檢驗(yàn)檢疫局;溫州出入境檢驗(yàn)檢疫局;西南大學(xué);
【關(guān)鍵詞】： 黑胸大蠊 高通量測(cè)序 轉(zhuǎn)錄組
【基金】：國(guó)家質(zhì)檢總局科技計(jì)劃項(xiàng)目(2015IK303) 浙江出入境檢驗(yàn)檢疫局科技計(jì)劃項(xiàng)目(2015-ZKZ-02)
【分類號(hào)】：R384
【正文快照】： 黑胸大蠊(Periplaneta fuliginosa)是南方常見的大蠊種類,屬蜚蠊目(Blattodea),蜚蠊科(Blattidae),大蠊屬(Peripalneta),是我國(guó)重要的病媒生物。適應(yīng)能力、繁殖能力、行動(dòng)能力很強(qiáng),能機(jī)械攜帶痢疾桿菌、大腸桿菌等腸道病原菌、病毒、霉菌和蛔蟲卵,對(duì)公共衛(wèi)生安全造成影響[1]。

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條

1 徐紹銳;汪世平;吳仕筠;肖小芹;曾少華;余俊龍;戴橄;羅臣;;黑胸大蠊室內(nèi)繁殖、發(fā)育的生物學(xué)特性研究[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2006年10期

2 柳建發(fā);汪世平;蔣雯雯;張R奸，

本文編號(hào)：728805