發(fā)布時(shí)間：2017-08-15 06:19

  本文關(guān)鍵詞：戈登菌mmpL3同源基因序列分析及功能預(yù)測(cè)

  更多相關(guān)文章： 支氣管戈登菌 mmpL同源基因 生物信息學(xué)分析

【摘要】：目的分析支氣管戈登菌臨床株mmpL3(Rv0206c)同源基因(Gbro4481)序列,并預(yù)測(cè)其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及功能,為Gbro4481蛋白的進(jìn)一步研究奠定基礎(chǔ)。方法根據(jù)全基因組測(cè)序結(jié)果和同源比對(duì)找到支氣管戈登菌的mmpL3同源基因,應(yīng)用expasy工具預(yù)測(cè)支氣管戈登菌MmpL3同源蛋白理化性質(zhì);利用Interproscan和Gene ontology工具對(duì)蛋白保守序列和功能進(jìn)行預(yù)測(cè);使用TMHMM在線工具進(jìn)行拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。結(jié)果篩選出MmpL3同源蛋白(Gbro4481),該蛋白含有2個(gè)膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)構(gòu)域和1個(gè)固醇敏感多肽區(qū);TMHMM預(yù)測(cè)Gbro4481蛋白有10個(gè)跨膜區(qū)。結(jié)論支氣管戈登菌的Gbro4481蛋白與結(jié)核分枝桿菌H37Rv的mmpL3蛋白同源,是分枝菌酸的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,參與胞內(nèi)小分子的運(yùn)輸和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。
【作者單位】： 武漢輕工大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院;上海公共衛(wèi)生臨床中心;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫與微生物學(xué)系;
【關(guān)鍵詞】： 支氣管戈登菌 mmpL同源基因 生物信息學(xué)分析
【基金】：武漢輕工大學(xué)研究生創(chuàng)新基金項(xiàng)目(No.2014cx019)
【分類號(hào)】：R378.91
【正文快照】： ***戈登菌與分枝桿菌同屬于抗酸染色陽(yáng)性菌,且能引起疑似結(jié)核病的肺部感染,易誤診為結(jié)核病,且對(duì)抗結(jié)核藥多耐藥。近年來(lái),武漢地區(qū)致病性戈登菌的感染呈逐漸上升的趨勢(shì)[1]。MmpL蛋白為分枝桿菌特有的一類蛋白,其中mmpL3基因編碼的膜蛋白參與分枝桿菌胞壁分枝菌酸的代謝,影響細(xì)

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本文編號(hào)：676655