目的:探索大鼠BPH組織完全去神經(jīng)支配后進行性萎縮過程中全基因表達譜動態(tài)變化情況。方法:29周齡雄性自發(fā)性高血壓大鼠(SHR,已自發(fā)形成BPH)12只,9只手術(shù)切斷前列腺全部支配神經(jīng)。分別于手術(shù)當(dāng)天取對照組(C)3只、術(shù)后3 d(D3)、7 d(D7)、11 d(D11)SHR各3只,取前列腺腹側(cè)葉進行組織病理學(xué)檢查和RNA提取,所有RNA樣本進行全基因表達譜芯片檢測、實時熒光PCR驗證和生物信息學(xué)分析。結(jié)果:完全去神經(jīng)支配后大鼠BPH組織進行性萎縮。各樣本全基因組表達譜芯片檢測均成功完成,隨機選擇的6個差異表達基因的實時熒光PCR結(jié)果證實芯片檢測可靠。分層聚類分析顯示:D3/C表達上調(diào)基因108個,下調(diào)基因175個;D7/C上調(diào)基因462個,下調(diào)基因189個;D11/C上調(diào)基因548個,下調(diào)基因256個。GO功能富集分析顯示各比較組差異表達的基因涉及數(shù)百上千數(shù)量不等的分子功能、生物學(xué)進程和細(xì)胞組分。Pathway通路富集分析顯示各比較組差異表達的基因涉及數(shù)百條信號通路,其中多條信號通路在各比較組均能富集到且排名靠前,其涉及的基因大部分都表達上調(diào),且大多數(shù)與補體系統(tǒng)激活相關(guān)。結(jié)論:完全...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實驗動物
    1.2 手術(shù)操作
    1.3 分組、標(biāo)本收集和處理
    1.4 蘇木素-伊紅(HE)染色
    1.5 RNA提取
    1.6 全基因表達譜芯片檢測及數(shù)據(jù)分析
    1.7 生物信息學(xué)和統(tǒng)計學(xué)分析
        1.7.1 分層聚類分析(hierarchical clustering analysis)
        1.7.2 基因本體(gene ontology, GO)功能富集分析
        1.7.3 pathway通路富集分析
    1.8 實時熒光PCR驗證分析
2 結(jié)果
    2.1 組織病理學(xué)變化
    2.2 微陣列檢測結(jié)果及基因組差異表達情況
    2.3 GO功能富集分析
    2.4 pathway通路富集分析
    2.5 實時熒光PCR驗證情況
3 討論



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