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基于iTRAQ技術(shù)的結(jié)核分枝桿菌定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究

發(fā)布時間:2021-09-05 05:25
  結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis, Mtb,簡稱結(jié)核桿菌)是結(jié)核病的主要致病菌。艾滋病合并結(jié)核病和耐多藥結(jié)核病使得結(jié)核病的診斷和治療成為全球面臨的重大挑戰(zhàn)。尋找結(jié)核桿菌新標(biāo)識分子用于結(jié)核病診斷或疫苗候選抗原具有重要意義,分子標(biāo)識的研究方法包括基因水平和蛋白質(zhì)水平,蛋白質(zhì)組學(xué)是在蛋白質(zhì)水平發(fā)現(xiàn)分子標(biāo)識的重要途徑之一。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)--相對和絕對定量的等量異位標(biāo)簽(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技術(shù)結(jié)合Nano-LC-MS/MS,對臨床分離的結(jié)核桿菌鏈霉素(SM)耐藥株01108、SM敏感株01105和H37Rv的全菌體蛋白進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究,通過相對定量分析SM耐藥株與敏感株間的差異蛋白質(zhì),基于巴斯德研究所功能分類樹,對兩組差異蛋白進(jìn)行相對分子量、等電點(diǎn)、酶分類以及功能分類分析,并根據(jù)差異蛋白理論分子量和等電點(diǎn)繪制了虛擬2D凝膠。同時,WEGO在線對差異蛋白進(jìn)行功能注釋聚類分析,并運(yùn)用KEGG對蛋白參與的信號通路進(jìn)行分析。SM耐藥株01108與SM敏感株01... 

【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:60 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)
    1.2 結(jié)核分枝桿菌蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展
第二章 基于iTRAQ技術(shù)的結(jié)核分枝桿菌定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究
    2.1 前言
    2.2 材料
        2.2.1 菌株
        2.2.2 主要試劑
        2.2.3 主要儀器設(shè)備
    2.3 方法
        2.3.1 菌株特征鑒定
        2.3.2 全菌體蛋白質(zhì)的提取
        2.3.3 Bradford法測定蛋白質(zhì)濃度
        2.3.4 雙向電泳檢測全菌體蛋白
        2.3.5 蛋白質(zhì)的復(fù)溶及還原烷基化
        2.3.6 蛋白質(zhì)的消化及PMF檢測消化效率
        2.3.7 iTRAQ 8 plex試劑標(biāo)記肽段
        2.3.8 半制備型HPLC分離肽段
        2.3.9 C_(18)反相色譜柱除鹽
        2.3.10 Nano-LC分離肽段及質(zhì)譜鑒定
        2.3.11 生物信息學(xué)分析
    2.4 結(jié)果
        2.4.1 菌株特征
        2.4.2 菌體蛋白定量及電泳檢測
        2.4.3 MALDI-TOF檢測消化及標(biāo)記效率
        2.4.4 半制備型HPLC分離肽段
        2.4.5 差異蛋白質(zhì)鑒定及相對定量
        2.4.6 差異蛋白理化性質(zhì)
        2.4.7 差異蛋白虛擬2D-gel
        2.4.8 差異蛋白質(zhì)功能分析
        2.4.9 差異蛋白功能聚類分析
    2.5 討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
發(fā)表論文


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國結(jié)核分枝桿菌寡核苷酸基因分型及其耐藥性分析[J]. 逄宇,夏輝,姜廣路,劉冠,梁倩,周楊,王勝芬,尚媛媛,趙冰,宋媛媛,趙雁林.  中華檢驗醫(yī)學(xué)雜志. 2011 (11)
[2]結(jié)核分枝桿菌異煙肼耐藥株和敏感株亞細(xì)胞蛋白質(zhì)組差異研究[J]. 陸曄,林成招,胡衡,梅建,武潔,沈鑫.  中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2011 (08)
[3]應(yīng)用8標(biāo)iTRAQ技術(shù)結(jié)合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差異蛋白質(zhì)組[J]. 張一甫,秦兆宇,劉曉慧,林成招,賀福初.  分析測試學(xué)報. 2010(05)
[4]結(jié)核分枝桿菌耐異煙肼菌株與敏感菌株的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究[J]. 姜昕,高峰,張文宏,胡忠義,王洪海.  中華結(jié)核和呼吸雜志. 2007(06)
[5]結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)物不同組份蛋白質(zhì)組研究[J]. 莊玉輝,何秀云,張小剛,李國利,闕海萍,劉紹軍.  微生物學(xué)報. 2002(03)
[6]重組結(jié)核分支桿菌38kD和16kD蛋白用于結(jié)核病血清學(xué)診斷的價值[J]. 張小剛,莊玉輝,何秀云,熊志紅,董恩軍,李書琳,張永勝,李昕.  中國防癆雜志. 2001(05)



本文編號:3384761

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