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腦缺血大鼠模型的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

發(fā)布時間:2021-04-06 22:20
  目的研究腦缺血大鼠與正常大鼠在基因表達(dá)方面的差異。方法將16只雄性大鼠隨機(jī)分為正常組、模型組,采用線栓法制備大鼠左側(cè)腦缺血模型,進(jìn)行RNA-seq測序。結(jié)果兩組之間存在530個差異基因,其中包括37個顯著差異基因和98個極顯著差異基因;虮倔w(GO)分析發(fā)現(xiàn),生物學(xué)過程和分子功能部分相關(guān)基因整體呈現(xiàn)上調(diào)趨勢,細(xì)胞組分相關(guān)的基因既有顯著上調(diào)趨勢也有顯著下調(diào)趨勢;通過基因和基因組京都百科全書數(shù)據(jù)庫(KEGG)通路分析發(fā)現(xiàn),P53信號通路相關(guān)基因顯著下調(diào),而固醇激素生物合成通路相關(guān)基因則顯著上調(diào)。結(jié)論腦缺血的形成可能與細(xì)胞凋亡、突觸后密度有很大關(guān)系,P53信號通路的下調(diào)、類固醇激素生物合成通路的上調(diào)可能影響腦缺血的形成。 

【文章來源】:國際藥學(xué)研究雜志. 2019,46(06)北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 實驗動物
    1.2 試劑
    1.3 分組及動物造模
    1.4 TTC染色
        1.4.1 TTC溶液配制
        1.4.2 腦組織切片
        1.4.3 染色并觀察
    1.5 HE染色
        1.5.1 脫蠟
        1.5.2 染色
        1.5.3 脫水、透明、封固
    1.6 組織取材及RNA測序
    1.7 生物信息分析
2 結(jié)果
    2.1 腦組織TTC染色結(jié)果
    2.2 HE染色結(jié)果
    2.3 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估
    2.4 基因表達(dá)豐度統(tǒng)計
    2.5 差異基因統(tǒng)計
    2.6 GO富集分析
    2.7 KEGG通路分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腦缺血再灌注損傷細(xì)胞凋亡機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 彭智遠(yuǎn),劉旺華,曹雯.  中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2017(08)
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[5]基于新一代高通量測序的環(huán)境微生物轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 蔡元鋒,賈仲君.  生物多樣性. 2013(04)
[6]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒.  遺傳. 2011(11)

博士論文
[1]基于RNA-Seq技術(shù)的雛鴕鳥胸腺應(yīng)答硼刺激分子機(jī)制研究[D]. 肖珂.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016

碩士論文
[1]大鼠腦缺血模型評價及大鼠腦缺血慢性期GFAP、NSE、SYN、Nogo-A表達(dá)與神經(jīng)功能轉(zhuǎn)歸的相關(guān)性[D]. 劉世民.南昌大學(xué) 2011



本文編號:3122258

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