發(fā)布時間：2021-01-27 09:03

　　目的:探討人端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因啟動子區(qū)的序列特征、轉(zhuǎn)錄因子及其結合位點。方法:從NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取人TERT基因組序列及其啟動子序列:利用EMBOSS 6. 6. 0、Cp G finder 1. 0和MethPrimer 1. 0軟件預測啟動子區(qū)Cp G島的位置;利用Patch 1. 0和PROMO 3. 0. 2軟件預測可與TERT基因結合的潛在轉(zhuǎn)錄因子及結合位點。結果:TERT基因定位于5p15. 33,基因序列全長共41 881 bp,其啟動子位于TERT基因5’端上游2 500 bp處,全長2 043bp。TERT基因啟動子區(qū)可能存在2個Cp G島和118個轉(zhuǎn)錄因子。結論:通過生物信息學軟件對h TERT基因啟動子進行預測分析,可提高對h TERT基因啟動子的研究效率,以便更加深入了解h TERT基因的調(diào)控機制及其生物學功能。 

【文章來源】：腫瘤預防與治療. 2020,33(03)

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

EMBOSS 6.6.0軟件預測的甲基化Cp G島圖譜

Cp G finder 1.0軟件預測的甲基化Cp G島圖譜

利用Patch 1.0程序搜索TRANSFAC數(shù)據(jù)庫，共獲得1 769個轉(zhuǎn)錄因子結合位點(包括小鼠和人類)，經(jīng)篩選后共得到911個人類的轉(zhuǎn)錄因子結合位點，手工匯總去重后共得到95個轉(zhuǎn)錄因子，主要包括AP-1、AP-2、CTCF、FOR1、GATA-1、P58、PXR-1、RAR-alpha1、Sp1、TCF-1A、TCF-4等(表1)。2.3.2 PROMO預測結果

【參考文獻】：
期刊論文
[1]喉鱗狀細胞癌及癌前病變R0切除術后復發(fā)危險因素研究[J]. 魯海珍,尹英愛,呂寧.  腫瘤預防與治療. 2019(07)



本文編號：3002789