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浙江省野生動(dòng)物鼬獾和家犬狂犬病病毒L基因序列測(cè)定分析

發(fā)布時(shí)間:2020-11-18 02:46
   目的測(cè)定浙江省野生動(dòng)物鼬獾和家犬狂犬病病毒L基因序列,在分子水平分析轉(zhuǎn)錄酶大蛋白(LP)的變異特點(diǎn)和遺傳進(jìn)化特征。方法對(duì)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)陽(yáng)性的狂犬病病毒標(biāo)本進(jìn)行L基因編碼區(qū)核酸序列測(cè)定,通過生物分析軟件比較L基因核苷酸序列和氨基酸序列,并與GenBank的36個(gè)參考序列編碼區(qū)進(jìn)行比對(duì)分析。結(jié)果測(cè)序獲得野生動(dòng)物鼬獾(F02、F04)和家犬(D01、D02)二種宿主來(lái)源的狂犬病病毒街毒株L基因核苷酸全長(zhǎng)序列并遞交GenBank,開放讀碼框(ORF)均為6 387 bp,編碼區(qū)均以2個(gè)連續(xù)的起始密碼子ATG起始,編碼2 128個(gè)氨基酸。在LP保守結(jié)構(gòu)域上的特異功能短序列幾乎完全保守,各結(jié)構(gòu)域之間的序列保守性略差,對(duì)存在的變異位點(diǎn)絕大多數(shù)極性并沒有變化,系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示浙江省鼬獾、犬街毒株均歸屬于傳統(tǒng)的狂犬病病毒Asian譜系,與我國(guó)廣泛傳播的狂犬病病毒同屬一種系。結(jié)論浙江省狂犬病病毒L基因的構(gòu)成與傳統(tǒng)狂犬病病毒一致,所構(gòu)建進(jìn)化樹的分析作用與N基因相同,鼬獾病毒依然具有本土狂犬病病毒的基因特點(diǎn),家犬病毒可能與我國(guó)多種宿主動(dòng)物病毒來(lái)源相同或者具有新近的相互傳播,不同宿主動(dòng)物狂犬病病毒具有種群多樣性的進(jìn)化特點(diǎn)和地域性流行特征。

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本文編號(hào):2888245

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