發(fā)布時(shí)間：2020-04-01 20:37

【摘要】：解釋常見(jiàn)復(fù)雜疾病的病因是遺傳研究中的一個(gè)主要挑戰(zhàn),通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析解釋復(fù)雜疾病的高遺傳度的重大突破仍然難以捉摸。為了克服這個(gè)困境,對(duì)復(fù)雜疾病的遺傳研究已經(jīng)采用了各種策略,如形成大型聯(lián)盟來(lái)增加樣本量和測(cè)序方法。在這里,我們主張從全基因組關(guān)聯(lián)分析出發(fā),把和復(fù)雜疾病相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)基因映射到蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)中,探索與復(fù)雜疾病相關(guān)基因的相互作用。為了找到核心中樞基因,我們?cè)谌蚪M關(guān)聯(lián)分析進(jìn)行后引入網(wǎng)絡(luò)分析。我們把基于全基因組關(guān)聯(lián)分析的復(fù)雜疾病的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究的方法構(gòu)建成為一個(gè)分析管道,并且利用阿爾茲海默癥來(lái)進(jìn)行驗(yàn)證,實(shí)驗(yàn)證明,網(wǎng)絡(luò)輔助的研究方法有助于研究復(fù)雜疾病的發(fā)病機(jī)制,可以作為全基因組關(guān)聯(lián)研究后的高階分析。然后,我們利用該分析管道分析了雙相障礙的基因相互作用,文章從WTCCC下載了和雙相障礙相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)據(jù)一共482,247個(gè),根據(jù)數(shù)據(jù)質(zhì)量控制等條件帥選后,得到6,458個(gè)風(fēng)險(xiǎn)單核苷酸多態(tài)性,按照方法中單核苷酸多態(tài)性定位到基因的方法,獲得2,045個(gè)風(fēng)險(xiǎn)基因。經(jīng)過(guò)基因富集分析后,將所獲得的風(fēng)險(xiǎn)基因映射到蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)112個(gè)度大于17的風(fēng)險(xiǎn)基因,其中有15個(gè)重復(fù)了以前報(bào)道過(guò)的和疾病關(guān)聯(lián)的重要基因,剩下的基因雖然沒(méi)有被報(bào)道過(guò),但是大多數(shù)基因都被報(bào)道過(guò)和其他腦部疾病、神經(jīng)類疾病、心血管疾病有關(guān)。對(duì)核心基因進(jìn)行模塊分析,發(fā)現(xiàn)了五個(gè)重要模塊和四個(gè)核心樞紐基因(FBXL13,WDFY2,bFGF和MTHFD1L)。檢查4個(gè)模塊的相互關(guān)聯(lián)的組件以及功能豐富分析揭示了雙相障礙風(fēng)險(xiǎn)的生物學(xué)意義的過(guò)程。這些核心樞紐基因尚未被報(bào)道與BD直接相關(guān),但可能通過(guò)間接與BD相關(guān)的基因相互作用而發(fā)揮功能。我們的方法為尋找與復(fù)雜疾病間接相關(guān)但又重要的基因產(chǎn)生了新的想法。
【圖文】：

染色體、基因、SNP位點(diǎn)三者之間的關(guān)系

中心法則
【學(xué)位授予單位】：重慶郵電大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：O157.5;R346;Q811.4

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 段忠取;朱軍;;全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展[J];浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版);2015年04期

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本文編號(hào)：2610923