【摘要】：目的應用生物信息學軟件預測結(jié)核分枝桿菌AccD5基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫獲取AccD5基本的基因信息;應用ProtParam軟件預測AccD5蛋白的理化性質(zhì);利用SignaIP 4.1和TMHMM分析其信號肽和跨膜區(qū);利用在線分析Expasy工具分析蛋白二級結(jié)構(gòu),建立蛋白三級結(jié)構(gòu)模型;利用BepiPred 1.0Server和SYFPEITHI分析蛋白的B細胞及T細胞抗原表位。結(jié)果AccD5蛋白共548個氨基酸,分子式為C2621H4153N727O810S17,分子質(zhì)量單位(Mr)為59.354 2×103,理論等電點為5.19,脂溶性系數(shù)為91.15,不穩(wěn)定性指數(shù)為31.21,親水性平均系數(shù)為-0.16,預測該蛋白為穩(wěn)定性親水性蛋白;二級結(jié)構(gòu)中α-螺旋、β-轉(zhuǎn)角、β-折疊、無規(guī)則卷曲分別占37.23%、10.58%、22.81%和29.38%,預測的B細胞、CTL細胞抗原表位分別為14個和25個。結(jié)論生物信息學分析AccD5為穩(wěn)定蛋白,含有潛在的B、T細胞抗原表位,為研發(fā)治療結(jié)核新藥提供了潛在靶標。

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