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慢性應(yīng)激損傷大鼠海馬組織全基因組表達(dá)譜芯片分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-25 15:43
【摘要】:目的基于基因表達(dá)譜芯片探討慢性應(yīng)激引起的基因表達(dá)變化,并分析差異基因集合的生物功能及信號(hào)通路。方法以Agilent表達(dá)譜芯片為載體,檢測(cè)慢性不可預(yù)知性應(yīng)激大鼠模型及正常對(duì)照組的基因表達(dá)譜,篩選差異基因,并做基因本體分析和信號(hào)通路分析。結(jié)果正常對(duì)照組與慢性應(yīng)激模型組相比,已知功能的差異表達(dá)基因共106個(gè),其中有56個(gè)基因表達(dá)上調(diào),涉及視黃醇代謝過(guò)程及視覺(jué)、氧化還原、ATP結(jié)合、輔酶結(jié)合等生物過(guò)程和分子功能;50個(gè)基因表達(dá)下調(diào),涉及離子通道合成及活性、細(xì)胞-細(xì)胞信號(hào)、突觸傳遞、脂質(zhì)合成、γ-氨基丁酸信號(hào)通路、γ-氨基丁酸受體活性、細(xì)胞膜組成等生物過(guò)程和分子功能;KEGG通路分析注釋到1個(gè)信號(hào)通路,即絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路。結(jié)論慢性不可預(yù)知性應(yīng)激刺激導(dǎo)致海馬神經(jīng)元處于應(yīng)激狀態(tài),神經(jīng)細(xì)胞膜的完整性及其周圍和內(nèi)部微環(huán)境穩(wěn)定性發(fā)生改變,細(xì)胞內(nèi)各種物質(zhì)及能量動(dòng)態(tài)平衡可能處于適應(yīng)性調(diào)整狀態(tài)或已遭到破壞。
[Abstract]:Objective to investigate the changes of gene expression induced by chronic stress based on gene expression microarray, and to analyze the biological function and signal pathway of differential gene set. Methods the gene expression profiles of chronic unpredictable stress rat model and normal control group were detected by using Agilent expression microarray as a vector. The differentially expressed genes were screened, and gene bulk analysis and signal pathway analysis were performed. Results compared with chronic stress model group, there were 106 known differentially expressed genes in normal control group, 56 of which were up-regulated, involving retinol metabolism and visual, redox, ATP binding. Biological processes and molecular functions such as coenzyme binding; The expression of 50 genes is down-regulated, including ion channel synthesis and activity, cell-cell signal, synaptic transmission, lipid synthesis, gamma-aminobutyric acid signaling pathway, gamma-aminobutyric acid receptor activity, cell membrane composition and other biological processes and molecular functions. One signal pathway, mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway, was identified by KEGG pathway analysis. Conclusion chronic unpredictable stress stimulates the hippocampal neurons in stress state and changes the integrity of the membrane and the stability of the surrounding and internal microenvironment. The dynamic balance of various substances and energy in the cell may be in an adaptive state or has been destroyed.
【作者單位】: 寧夏醫(yī)科大學(xué)中醫(yī)學(xué)院、寧夏醫(yī)科大學(xué)回醫(yī)藥重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(編號(hào):81260515)
【分類號(hào)】:R363

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本文編號(hào):2356638

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