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新發(fā)蟲(chóng)媒病毒:基因A型版納病毒全基因組序列擴(kuò)增引物

發(fā)布時(shí)間:2017-11-28 11:30

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【摘要】:目的設(shè)計(jì)版納病毒型別特異性測(cè)序引物,為構(gòu)建快速高效經(jīng)濟(jì)的版納病毒全基因組測(cè)序平臺(tái)奠定基礎(chǔ)。方法根據(jù)Gen Bank已知的版納病毒基因序列信息進(jìn)行基因型分析,采用Primer Premier v6.0及Oligo 7.56軟件完成版納病毒亞型特異性擴(kuò)增引物的設(shè)計(jì)與評(píng)估。使用中國(guó)分離的30株版納病毒進(jìn)行版納病毒型別特異性引物工作效率驗(yàn)證和評(píng)估。結(jié)果通過(guò)對(duì)30株隸屬于2個(gè)不同基因亞型的版納病毒開(kāi)展全基因組序列測(cè)定,獲得2套型別工作效率高、擴(kuò)增效果穩(wěn)定的基因A型特異性版納病毒全基因組序列擴(kuò)增測(cè)序引物。基因A1亞型引物一套共26對(duì);基因A2亞型引物一套共計(jì)30對(duì)。完成了30株版納病毒全基因組序列擴(kuò)增。結(jié)論設(shè)計(jì)的版納病毒型別特異性擴(kuò)增測(cè)序引物可以高效準(zhǔn)確地完成版納病毒全基因組序列擴(kuò)增,為進(jìn)一步深入研究版納病毒分子生物學(xué)特征奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 山東理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物技術(shù)系;中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所病毒性腦炎室傳染病預(yù)防控制國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目(81290342);國(guó)家自然科學(xué)基金(81301479,81501757) 山東省自然科學(xué)基金(ZR2013HQ008) 傳染病預(yù)防和控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室發(fā)展項(xiàng)目(2014SKLID103)~~
【分類(lèi)號(hào)】:R373
【正文快照】: 版納病毒是呼腸孤病毒科新建立的Seadornavirus病毒屬的模式病毒[1]。該病毒于1987年首次從我國(guó)病毒性腦炎患者中分離[2],此后相繼在多種動(dòng)物宿主和蚊蟲(chóng)媒介中分離[3],廣泛分布在我國(guó)和東南亞 地區(qū),2013年,版納樣病毒在匈牙利巴拉頓湖的淡水鯉魚(yú)中分離[4]。版納病毒宿主媒介

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 劉紅;梁國(guó)棟;;版納病毒及其感染[J];中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志;2010年05期

2 孟維珊;李銘華;付士紅;張稷博;張立田;陳哲;丁俊;梁國(guó)棟;;遼寧省丹東市鴨綠江沿岸2007年蟲(chóng)媒病毒分離鑒定[J];中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志;2012年05期

3 曹玉璽;付士紅;張稷博;孟維珊;王煥琴;何英;王環(huán)宇;郭軍巧;梁國(guó)棟;;遼寧省部分地區(qū)2008年蟲(chóng)媒病毒分離鑒定[J];中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志;2012年02期

4 徐麗宏;梁國(guó)棟;;引起人類(lèi)腦炎的新雙鏈RNA病毒[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;2006年03期

5 ;[J];;年期

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 劉紅;版納病毒全基因組序列特征及其分子進(jìn)化研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2011年

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本文編號(hào):1233833

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