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【摘要】：在127 065條血凝素、神經(jīng)氨酸酶流感病毒蛋白基礎(chǔ)上,提出基于粗�；牟《镜鞍走M化樹的構(gòu)建方法.首先基于病毒蛋白序列特征,給出序列間相似性度量,提取流感病毒系統(tǒng)層次遞階結(jié)構(gòu),并定義層次聚類指標,確定最佳聚類數(shù).然后基于距離中心最近的原則提取流感病毒系統(tǒng)代表.最后采用距離度量構(gòu)造流感病毒進化樹.實驗表明,相同流感病毒具有宿主相同、時間跨度較小、爆發(fā)地點相近,更傾向于處于相同分支的特點,這與已有的文獻吻合,因此該方法有利于挖掘病毒變異軌跡.
【作者單位】： 江南大學理學院;
【關(guān)鍵詞】： 流感病毒 進化樹 粗�；� 結(jié)構(gòu)聚類 大數(shù)據(jù)處理
【基金】：國家自然科學基金項目(No.11371174) 國際科技合作研究項目(No.2011DFR70500)資助~~
【分類號】：R373;Q811.4
【正文快照】： Supported by National Natural Science Foundation of China(No.11371174),International Science and Technology CooperationProgram of China(No.2011DFR70500)LI Yang,TANG Xuqing(School of Science,Jiangnan University,Wuxi 214122)Citation LI Y,TANG X Q.Construct，

本文編號：1022808