海南百歲老人中線粒體基因突變與女性長(zhǎng)壽關(guān)聯(lián)性研究
本文關(guān)鍵詞:海南百歲老人中線粒體基因突變與女性長(zhǎng)壽關(guān)聯(lián)性研究
更多相關(guān)文章: 長(zhǎng)壽 線粒體基因 突變 線粒體氧化磷酸化
【摘要】:背景和目的:研究指出在長(zhǎng)壽老人中普遍保持能量代謝功能,提示線粒體是細(xì)胞/組織產(chǎn)生能量的重要器官,并且在人類長(zhǎng)壽中有重要作用。有研究指出線粒體基因突變通過(guò)降低電子傳遞鏈的功能,減少自由基的生成,產(chǎn)生有益于長(zhǎng)壽表型的作用。本研究以線粒體基因組為主要研究對(duì)象,使用第二代高通量測(cè)序技術(shù)(NGS)對(duì)17個(gè)來(lái)自海南萬(wàn)寧縣的百歲老人的線粒體基因組進(jìn)行測(cè)序,分析mtDNA突變與個(gè)體壽命之間的關(guān)系,為進(jìn)一步探討長(zhǎng)壽基因與信號(hào)傳導(dǎo)通路變化提供依據(jù)。方法:本研究中,我們通過(guò)評(píng)估長(zhǎng)壽組和年輕組的線粒體DNA測(cè)序結(jié)果,對(duì)比兩組總SNP頻率,個(gè)體SNP頻率,SNPs產(chǎn)生效應(yīng),在特定mtDNA區(qū)域SNP累積。將變異結(jié)果用Burrows-Wheeler Aligner (BWA)比對(duì)到線粒體基因組上;用GATK軟件對(duì)SNP和InDel進(jìn)行變異檢測(cè),用ANNOVAR軟件同時(shí)關(guān)聯(lián)多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)(如dbSNP, 1000g, ESP6500等)對(duì)變異結(jié)果進(jìn)行注釋。結(jié)果:1:選取海南地區(qū),年齡在100歲以上(100±2歲)的女性老人17人。17例百歲老人中文盲17例(100.0%),農(nóng)林牧漁勞動(dòng)者13例(76.5%),婚姻狀況喪偶15例(88.2%),吸煙17例(100.0%,其中1例已戒煙),飲酒0例,飲茶5例(29.4%),大便1次/1-2d17例(100.0%);有親屬年齡85歲2例(11.7%),親屬年齡無(wú)85歲11例(64.7%),無(wú)法考證4例(23.5%);無(wú)重要疾病(心肺腦(老年癡呆))17例(100%);老年性耳聾0例(0%)2:所有mtDNA測(cè)序數(shù)據(jù)和rCRS對(duì)比。線粒體總長(zhǎng)16596bp,在794個(gè)位點(diǎn)上總共發(fā)生355個(gè)不同的單堿基突變SNV.檢測(cè)到的突變類型大多數(shù)是轉(zhuǎn)換(93.1%的實(shí)驗(yàn)組和81.7%的對(duì)照組),而顛換、插入和缺失相對(duì)較少。3:調(diào)查SNP分布顯示不同。4:在實(shí)驗(yàn)組內(nèi)發(fā)現(xiàn)11個(gè)突變位點(diǎn),所有的實(shí)驗(yàn)樣本在這些位點(diǎn)上都發(fā)生突變;5:在實(shí)驗(yàn)組內(nèi)發(fā)現(xiàn)9個(gè)突變基因,所有的實(shí)驗(yàn)樣本在這些基因上都發(fā)生突變;6:D-loop突變型在實(shí)驗(yàn)組內(nèi)的頻率顯著高于對(duì)照組(P=0.021);移碼突變?cè)趯?duì)照組內(nèi)的頻率顯著高于實(shí)驗(yàn)組(P=0.0000);7:線粒體完整性未發(fā)現(xiàn)異常;8:發(fā)現(xiàn)了3個(gè)mtSNPs(m.310TC或TTC,m.3105ACA,m.4048GA)與長(zhǎng)壽關(guān)聯(lián),其中非同義突變m.4048GA(Asp248Asn)在功能上可能起重要的保護(hù)作用。9:發(fā)現(xiàn)4個(gè)基因或區(qū)域(RNR1, RNR2, "RNR1,TRNF", "TRNP;CYTB,TRNT")在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組之間存在顯著差異。結(jié)論:1.MT-RNR1基因突變可能與百歲老人聽(tīng)力良好相關(guān),MT-RNR2基因突變可能與百歲老人認(rèn)知能力較強(qiáng)相關(guān);2.ND1在4048位點(diǎn)突變可能減少活性氧簇的產(chǎn)生,與百歲老人長(zhǎng)壽相關(guān);3.線粒體基因組突變和線粒體氧化磷酸化功能,能量狀態(tài)良好,與長(zhǎng)壽和衰老相關(guān)。
【關(guān)鍵詞】:長(zhǎng)壽 線粒體基因 突變 線粒體氧化磷酸化
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R339.36
【目錄】:
- 英文縮寫(xiě)詞表5-7
- 中文摘要7-9
- 英文摘要9-11
- 前言11-14
- 對(duì)象和方法14-18
- 結(jié)果18-27
- 討論27-30
- 結(jié)論30-31
- 參考文獻(xiàn)31-37
- 文獻(xiàn)綜述37-57
- 參考文獻(xiàn)49-57
- 碩士期間發(fā)表文章57-58
- 致謝58
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