黃櫨的景觀基因組學研究
發(fā)布時間:2021-11-22 17:10
環(huán)境可以通過施加選擇性壓力和限制遷移來影響生物的進化軌跡。物種對環(huán)境響應的適應性進化是分子生態(tài)學和進化生物學的關(guān)鍵問題。在缺乏強大選擇壓力的地區(qū),物種的適應性分化方向通常是多樣的。然而,區(qū)域物種自適應分化的驅(qū)動機制至今尚未確定。在本研究中,我們使用了景觀基因組學方法來推斷中國的暖溫帶地區(qū)黃櫨的適應性進化。黃櫨(Cotinus coggygria),落葉小喬木或灌木,是我國重要的觀賞紅葉樹種,著名的北京香山紅葉就是本樹種。該樹種原產(chǎn)于東亞到中亞的大部分地區(qū)和中國北部的喜馬拉雅山。它廣泛的分布在中國暖溫帶地區(qū),其生長的海拔范圍在330-2400米。在中國主要分布在河北,河南,湖北,陜西,山東和山西省。景觀基因組學通過鑒定適應性遺傳變異的環(huán)境驅(qū)動因素和揭示相關(guān)景觀格局來研究其適應性分化。在本次實驗中,我們選用黃櫨為研究對象,對其適應性遺傳印記和環(huán)境異質(zhì)性之間的關(guān)系進行研究,結(jié)果如下:(1)我們用SCo T分子標記對黃櫨進行景觀基因組學研究。實驗中共選取了9個SCo T引物用來研究黃櫨種群遺傳結(jié)構(gòu),共選用1131個的SCo T位點。對所有位點進行貝葉斯分析表明,15個黃櫨種群被分成東部、西部兩...
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學河南省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖115個采樣地黃櫨種群的位置
圖 2 部分 PCR 產(chǎn)物的電泳圖譜Fig. 2 The electrophorograms of some PCR productsker 2.2.0 (SoftGenetics, State College, Pennsylvania, USA)觀基因概率,選擇峰值在 60-1000 bp 之間,高度在 300 以上的波。 1.0(Vekemans et al., 2002)計算每個群體的遺傳參數(shù)。主要性等位基因百分比(PPA)、Nei 的基因多樣性(HE)(Nei et個等位基因的基因頻率。分析,用 STRUCTURE 2.3.4(Pritchard et al., 2000)軟件對黃中,選擇了一個不含獨立等位基因頻率的非混合模型。為了計試,對每個 K 值獨立運行進行了 10 次。馬爾可夫鏈--蒙特卡計算方法。K 的最佳值的選擇是基于 Evanno 等人提出的方法(工具 Structure Harvester(Earl et al., 2012)分析。運用 STR
表 4 排序軸與環(huán)境變量的相關(guān)性.Table 4 Correlations between environmental variables and the ordination axes.ironmental variable Axis 1 Axis 2 Axis 3 Axis 4Bio3 0.327 -0.523*0.436 0.475Bio5 0.251 -0.702**-0.082 0.065Bio6 0.283 0.062 -0.459 -0.303Bio7 0.053 -0.846**0.282 0.321Bio11 0.297 -0.213 -0.332 -0.185Bio12 0.331 0.750**-0.270 -0.257Bio14 0.471 0.444 -0.166 -0.403Bio15 0.192 -0.637**-0.063 0.510*Bio18 0.689**0.415 -0.323 -0.071
【參考文獻】:
期刊論文
[1]承德市黃櫨常見病蟲害綜合防治方法[J]. 崔立明,劉紅梅,徐軍生,王世平. 北方園藝. 2016(24)
[2]景觀遺傳學中Mantel檢驗和dbRDA統(tǒng)計方法的對比分析[J]. 李曉謙,朱京海,宋有濤. 遼寧大學學報(自然科學版). 2015(04)
[3]中國暖溫帶山地植被生態(tài)學研究進展[J]. 上官鐵梁,李晉鵬,郭東罡. 山地學報. 2009(02)
[4]黃櫨的抗凝血作用[J]. 崔恩賢,龍麗輝,劉靜,曹永孝. 中藥材. 2007(02)
[5]美國紅櫨的組培快繁試驗[J]. 李雙云,馮建華,劉翠蘭,李麗. 山東林業(yè)科技. 2005(05)
[6]黃櫨的組織培養(yǎng)研究[J]. 苗青,曲波,邵美妮,翟強,陳之應. 遼寧林業(yè)科技. 2005(01)
[7]暖溫帶若干落葉闊葉林群落物種多樣性及其與群落動態(tài)的關(guān)系[J]. 高賢明,馬克平,陳靈芝. 植物生態(tài)學報. 2001(03)
[8]黃櫨沖劑的制備及質(zhì)控方法[J]. 李建華,張正臣,申慶亮. 中成藥. 1992(10)
本文編號:3512119
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學河南省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖115個采樣地黃櫨種群的位置
圖 2 部分 PCR 產(chǎn)物的電泳圖譜Fig. 2 The electrophorograms of some PCR productsker 2.2.0 (SoftGenetics, State College, Pennsylvania, USA)觀基因概率,選擇峰值在 60-1000 bp 之間,高度在 300 以上的波。 1.0(Vekemans et al., 2002)計算每個群體的遺傳參數(shù)。主要性等位基因百分比(PPA)、Nei 的基因多樣性(HE)(Nei et個等位基因的基因頻率。分析,用 STRUCTURE 2.3.4(Pritchard et al., 2000)軟件對黃中,選擇了一個不含獨立等位基因頻率的非混合模型。為了計試,對每個 K 值獨立運行進行了 10 次。馬爾可夫鏈--蒙特卡計算方法。K 的最佳值的選擇是基于 Evanno 等人提出的方法(工具 Structure Harvester(Earl et al., 2012)分析。運用 STR
表 4 排序軸與環(huán)境變量的相關(guān)性.Table 4 Correlations between environmental variables and the ordination axes.ironmental variable Axis 1 Axis 2 Axis 3 Axis 4Bio3 0.327 -0.523*0.436 0.475Bio5 0.251 -0.702**-0.082 0.065Bio6 0.283 0.062 -0.459 -0.303Bio7 0.053 -0.846**0.282 0.321Bio11 0.297 -0.213 -0.332 -0.185Bio12 0.331 0.750**-0.270 -0.257Bio14 0.471 0.444 -0.166 -0.403Bio15 0.192 -0.637**-0.063 0.510*Bio18 0.689**0.415 -0.323 -0.071
【參考文獻】:
期刊論文
[1]承德市黃櫨常見病蟲害綜合防治方法[J]. 崔立明,劉紅梅,徐軍生,王世平. 北方園藝. 2016(24)
[2]景觀遺傳學中Mantel檢驗和dbRDA統(tǒng)計方法的對比分析[J]. 李曉謙,朱京海,宋有濤. 遼寧大學學報(自然科學版). 2015(04)
[3]中國暖溫帶山地植被生態(tài)學研究進展[J]. 上官鐵梁,李晉鵬,郭東罡. 山地學報. 2009(02)
[4]黃櫨的抗凝血作用[J]. 崔恩賢,龍麗輝,劉靜,曹永孝. 中藥材. 2007(02)
[5]美國紅櫨的組培快繁試驗[J]. 李雙云,馮建華,劉翠蘭,李麗. 山東林業(yè)科技. 2005(05)
[6]黃櫨的組織培養(yǎng)研究[J]. 苗青,曲波,邵美妮,翟強,陳之應. 遼寧林業(yè)科技. 2005(01)
[7]暖溫帶若干落葉闊葉林群落物種多樣性及其與群落動態(tài)的關(guān)系[J]. 高賢明,馬克平,陳靈芝. 植物生態(tài)學報. 2001(03)
[8]黃櫨沖劑的制備及質(zhì)控方法[J]. 李建華,張正臣,申慶亮. 中成藥. 1992(10)
本文編號:3512119
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