中國山茶科植物區(qū)系及葉綠體基因組結構進化分析
發(fā)布時間:2024-03-12 02:52
對中國種子植物屬的分布區(qū)類型進行屬的區(qū)系分析,并統(tǒng)計了中國不同地區(qū)山茶科植物的分布情況,以測序完成的14個屬14種山茶科植物葉綠體基因組為研究對象,系統(tǒng)比較基因組間的結構差異,分析4個IR邊界擴張與收縮情況,并以近緣物種圓葉鹿蹄草為外類群,使用MEGA 4.0構建系統(tǒng)進化樹,分析物種間的親緣關系。結果表明,我國山茶科植物共計15屬,主要為熱帶亞熱帶成分的涉及9個屬,占山茶科總分布包含屬的60%。所分析的14種山茶科植物基因組長度各一,折柄茶屬的心葉折柄茶葉綠體基因組最大,為158 450 bp,而最小的柃木屬翅柃大小為155 179 bp,差異接近3.3 kb。以杜鵑目下鹿蹄草科的圓葉鹿蹄草為外類群,對14種山茶科植物構建了系統(tǒng)進化樹,一共12個節(jié)點,支持率較高,山茶科14個種被分成2個大的進化枝,紅皮紫莖和心葉折柄茶親緣關系近,厚皮香屬的厚皮香與山茶科的所屬關系存在爭議。結合植物區(qū)系分析與葉綠體基因組的結構進化分析方法,反映出山茶科植物的進化發(fā)育關系,為解決這類問題提供參考信息。
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【部分圖文】:
本文編號:3926426
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圖114種山茶科植物葉綠體基因組可視化結構比較
紫莖屬為東亞及北美間斷分布類型,與李捷等[21]結果一致,即中國南部和西南部是紫莖屬的起源中心和高度分化中心,并就紫莖屬和舟柄茶屬的關系進行了探討[21]。而在《FloraofChina》中,T.L.Mingetal[22]將折柄茶屬歸并入紫莖屬。本研究對這2屬的代表種紅....
圖2基于山茶科葉綠體全基因組序列構建系統(tǒng)進化樹
圖114種山茶科植物葉綠體基因組可視化結構比較前人在對山茶科進行分類時,常常將山茶科下的厚皮香屬特意分出來進行討論,尤其是發(fā)現(xiàn)葉表皮等結構特征上有顯著差異[23-24]。我們對葉綠體基因組的研究發(fā)現(xiàn),厚皮香屬的厚皮香與茶梨屬的茶梨有較近的親緣關系,根據所構建的進化樹可以看出,與....
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