發(fā)布時間：2023-12-24 15:32

　　以一年生實生山桃苗為試材,通過正常培養(yǎng)、干旱脅迫以及干旱脅迫下外施脫落酸(ABA)的山桃葉片進行高通量轉(zhuǎn)錄組測序分析,探究山桃響應干旱脅迫的分子機制,篩選響應ABA處理的功能基因。結(jié)果表明:試驗共構建9個文庫進行轉(zhuǎn)錄組測序。轉(zhuǎn)錄組測序共獲得67.14 Gb Clean Data,各樣品Clean Data均達到5.81 Gb,Q30堿基百分比在91.71%及以上。與對照相比,干旱處理組差異表達基因顯著上調(diào)596個,下調(diào)1 025個。與干旱處理組相比,干旱+ABA處理組差異表達基因顯著上調(diào)394個,下調(diào)117個。GO富集分析表明:對照組、干旱處理組和干旱+ABA處理組在生物學途徑中富集最多的類別都是代謝過程;在細胞組件和分子功能中, 3個不同處理組富集最多的基因類別均是細胞組分和催化活性相關的基因。KEGG富集分析表明:與對照相比,干旱處理組的樣本有260個差異表達基因參與72條代謝途徑;與干旱處理組相比,干旱+ABA處理組的樣本有66個差異表達基因參與了38條代謝途徑。經(jīng)KEGG顯著性富集分析,篩選到淀粉和蔗糖代謝、植物激素信號轉(zhuǎn)導等相關基因。采用實時熒光定量PCR對篩選到的基因進行了...

【文章頁數(shù)】：12 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 山桃總RNA的提取及c DNA的合成
    1.3 質(zhì)量文庫的評估
    1.4 差異基因篩選
    1.5 差異表達基因的功能注釋與富集分析
    1.6 差異表達基因熒光定量PCR分析
2 實驗結(jié)果
    2.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
    2.2 樣本基因的注釋和差異表達基因的篩選分析
    2.3 差異表達基因的Gene Ontology富集分析
    2.4 差異表達基因的KEGG注釋
    2.5 關鍵基因的差異表達分析
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