基于高通量測序技術(shù)的紅棗黑斑病病原菌分離與鑒定
發(fā)布時間:2023-04-25 23:26
通過探究造成南疆紅棗黑斑病的主要病原菌類別,為該病的靶向防治奠定理論基礎(chǔ)。采用高通量測序技術(shù)和傳統(tǒng)分離鑒定相結(jié)合的方法分別對南疆的喀什、和田、阿克蘇等3個地區(qū)患病紅棗黑斑部位進行病原菌鑒定。結(jié)果表明,從27個樣品中獲得91 137個高質(zhì)量序列,其中相對豐度最高的菌門是子囊菌門,相對豐度最高的菌屬是鏈格孢屬(Alternaria),3個地區(qū)鏈格孢屬的相對豐度分別是99.98%、98.15%、99.92%,其他菌屬的相對豐度均在0.95%以下。通過對患病果實樣品和代表菌株進行組織分離、形態(tài)學(xué)觀察、分子生物學(xué)分析和病理學(xué)接種試驗,明確造成南疆紅棗黑斑病的主要病原菌是鏈格孢(Alternaria alternata),占85.6%。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
1.2.1 DNA的提取和MiSeq測序
1.2.2 數(shù)據(jù)分析
1.2.3 病原物分離與純化
1.2.4 致病性測定
1.2.5 病原菌鑒定
1.2.5.1 菌株形態(tài)觀察
1.2.5.2 菌株分子鑒定
2 結(jié)果與分析
2.1 物種組成分析
2.2 病原物的分離結(jié)果
2.3 病原菌鑒定
2.3.1 形態(tài)學(xué)鑒定
2.4 致病性測定
3 討論
本文編號:3801272
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1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
1.2.1 DNA的提取和MiSeq測序
1.2.2 數(shù)據(jù)分析
1.2.3 病原物分離與純化
1.2.4 致病性測定
1.2.5 病原菌鑒定
1.2.5.1 菌株形態(tài)觀察
1.2.5.2 菌株分子鑒定
2 結(jié)果與分析
2.1 物種組成分析
2.2 病原物的分離結(jié)果
2.3 病原菌鑒定
2.3.1 形態(tài)學(xué)鑒定
2.4 致病性測定
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