MicroRNA是一種18～22 nt的內(nèi)源性非編碼RNA,在植物的諸多代謝途徑中起到調(diào)控作用,其中,miR156家族是植物生長(zhǎng)發(fā)育及次生代謝過(guò)程重要調(diào)控因子。本研究采用C-mii工具,利用藥用植物基因組資源數(shù)據(jù)庫(kù)提供的長(zhǎng)春花轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),對(duì)潛在的成熟miR156序列及其前體結(jié)構(gòu)進(jìn)行識(shí)別和預(yù)測(cè)。最終得到21個(gè)miRNA家族的識(shí)別結(jié)果,共574條miRNA預(yù)測(cè)序列,其中miR156家族共4個(gè)成員,篩選得到2個(gè)miR156家族成熟序列和前體序列二級(jí)結(jié)構(gòu),分別命名為Cro-miR156a及Cro-miR156c。

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【文章目錄】：
0 引 言
1 實(shí) 驗(yàn)
    1.1 數(shù)據(jù)庫(kù)及工具
    1.2 方 法
        1.2.1 同源搜索
        1.2.2 初級(jí)miRNA折疊
        1.2.3 前體miRNA折疊及人工篩選
2 結(jié)果與討論
    2.1 同源搜索結(jié)果
    2.2 初級(jí)miRNA折疊結(jié)果
    2.3 前體miRNA及人工篩選折疊結(jié)果
    2.4 前體序列BLAST驗(yàn)證與討論
    2.5 Cro-miR156靶位點(diǎn)預(yù)測(cè)及檢驗(yàn)
3 結(jié) 論



本文編號(hào)：3743775