該試驗(yàn)旨在通過(guò)生物信息學(xué)方法分析沙特番茄黃化曲葉病毒AC2基因編碼的轉(zhuǎn)錄激活蛋白TrAP（transcriptional activator protein）的結(jié)構(gòu)及功能。該文通過(guò)在線軟件預(yù)測(cè)和分析了番茄中AC2基因編碼蛋白的一級(jí)結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、磷酸位點(diǎn)、糖基位點(diǎn)、三級(jí)結(jié)構(gòu)及其重要的功能;通過(guò)最大似然法對(duì)不同物種AC2基因編碼蛋白序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)果表明:番茄中AC2基因共編碼135個(gè)氨基酸,且編碼蛋白屬于不穩(wěn)定的親水性蛋白質(zhì);二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)則卷曲折疊為主,比例為58.52%;該蛋白不存在跨膜結(jié)構(gòu)域,屬非跨膜蛋白且不存在信號(hào)肽;該蛋白1～129個(gè)氨基酸區(qū)域?yàn)殡p生病毒超基因家族（Gemini_AL2 superfamily）結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)進(jìn)化情況和植物分類學(xué)基本一致,沙特番茄雙生病毒AC2基因與南非木薯間的親緣關(guān)系最近。該基因編碼蛋白結(jié)構(gòu)與功能的分析為進(jìn)一步研究AC2雙生病毒基因家族奠定了基礎(chǔ),同時(shí)為番茄抗病在病蟲害防治方面提供一種可行的思路。 

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 序列來(lái)源
    1.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析預(yù)測(cè)
        1.2.1 一級(jí)結(jié)構(gòu)
        1.2.2 二級(jí)結(jié)構(gòu)
        1.2.3磷酸化位點(diǎn)和糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
        1.2.4 結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
        1.2.5 三級(jí)結(jié)構(gòu)
    1.3 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 沙特番茄黃化曲葉病毒Tr AP氨基酸序列
    2.2 蛋白結(jié)構(gòu)分析
        2.2.1 一級(jí)結(jié)構(gòu)
        2.2.2 二級(jí)結(jié)構(gòu)分析預(yù)測(cè)
        2.2.3磷酸化位點(diǎn)和糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
        2.2.4 結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
        2.2.5 三級(jí)結(jié)構(gòu)
    2.3 AC基因編碼蛋白的系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]豬T細(xì)胞受體β鏈基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 李玩生,劉磊,馮海燕,房永祥,景志忠.  甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(03)
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本文編號(hào)：3720996