為了解桃中YABBY家族的成員和特征,本研究基于桃（Prunus persica）最新基因組組裝注釋數(shù)據(jù),首次通過生物信息學(xué)手段系統(tǒng)鑒定并分析了YABBY基因家族特征,包括染色體定位、蛋白特征、基因結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系、保守結(jié)構(gòu)域、啟動子區(qū)域順式元件。結(jié)果顯示:桃中含有6個YABBY基因,分布在5條染色體上,其推導(dǎo)蛋白序列較短,分子量較小。家族成員含有4～6個內(nèi)含子,結(jié)構(gòu)較為復(fù)雜。桃中YABBY基因含有植物YABBY家族所有5個亞類,即CRC、INO、FIL/YAB3、YAB2和YAB5,且均含有保守的鋅指結(jié)構(gòu)和YABBY結(jié)構(gòu)域。除了核心啟動元件,桃YABBY基因還含有大量光應(yīng)答、激素響應(yīng)等順式作用元件,表明該家族基因的表達(dá)可能會受到環(huán)境、激素等的影響。本研究初步研究了桃基因組中YABBY基因家族的特征,為后期該基因家族在桃中的功能驗(yàn)證提供了理論支撐。 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)來源
    1.2 桃YABBY基因的鑒定及分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 桃YABBY家族成員的鑒定及蛋白特征
    2.2 桃YABBY家族基因結(jié)構(gòu)分析
    2.3 桃YABBY基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化特征
    2.4 桃YABBY基因在染色體上的分布特征
    2.5 桃YABBY基因啟動子順勢作用元件預(yù)測
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