膠孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）是引發(fā)芒果（Mangifera indica）炭疽病的主要病原體。室內平板培養(yǎng)膠孢炭疽菌不產生或產生很少分生孢子的情況時有發(fā)生,但菌絲在機械損傷后24–48小時會產生大量分生孢子。膠孢炭疽菌應答機械損傷誘導產孢的核心基因及關鍵代謝通路尚未見報道。基于轉錄組測序（RNA-seq）技術檢測了芒果膠孢炭疽菌菌絲在機械損傷處理后2小時內5個時間點的基因表達變化,對差異表達基因進行GO富集和KEGG代謝通路富集分析,并對菌絲響應脅迫的基因動態(tài)表達數(shù)據進行分析。基于常微分方程ODE模型結合變量選擇技術,構建了動態(tài)基因調控網絡。結果表明,有417個差異表達基因參與應答膠孢炭疽菌菌絲機械損傷,分屬12個聚類模塊,有4條通路存在顯著富集,分別是丙酮酸代謝、硫代謝、黃曲霉素合成途徑和二萜合成途徑。結合功能注釋篩選出12個應答菌絲損傷脅迫的核心基因。研究結果為后續(xù)深入開展芒果膠孢炭疽菌產孢和致病機理研究奠定了重要基礎。 

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 供試菌株
    1.2 機械損傷處理菌絲轉錄組樣品制備方法
    1.3 RNA提取及高通量測序文庫構建
    1.4 序列分析及注釋
    1.5 差異基因篩選與功能富集分析
    1.6 聚類分析
    1.7 調控網絡構建
    1.8 實時熒光定量PCR分析
    1.9 數(shù)據分析
2 結果與討論
    2.1 測序結果和統(tǒng)計
    2.2 差異基因篩選與富集
    2.3 基因表達模式解析
    2.4 聚類模塊的生物學富集
    2.5 脅迫響應基因調控網絡
    2.6 應答損傷脅迫基因的動態(tài)表達模式驗證
    2.7 討論


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]柱花草膠孢炭疽菌基因組、轉錄組測序及致病相關基因CgALS分析研究[D]. 黃華平.海南大學 2016
[2]鹽脅迫下胡楊的生理響應及miRNA表達動態(tài)變化[D]. 周韜.北京林業(yè)大學 2014

碩士論文
[1]芒果膠孢炭疽病菌遺傳轉化體系的建立[D]. 李偉.華南熱帶農業(yè)大學 2004



本文編號：3667174