以西藏特有瀕危藏藥材大花黃牡丹為材料,利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)大花黃牡丹不同組織內(nèi)生真菌及根際土壤真菌的ITS（Internal transcribed spacer）序列進(jìn)行測(cè)序和分析。結(jié)果表明:所有樣品中共獲得真菌OTUs （Operational taxonomic units）796個(gè),其中,根部228個(gè),莖部55個(gè),葉部70個(gè),花部110個(gè),果實(shí)69個(gè),上、中、下根際土壤分別為421、319和258個(gè),隸屬8門13綱27目50科67屬。大花黃牡丹不同植物組織中共有5個(gè)OTUs,不同深度根際土壤共有135個(gè)OTUs。Biomarker分析表明在植物組織中的標(biāo)志類群是Mycosphaerellaceae和Cladosporiaceae,土壤中的標(biāo)志性類群是Nectriaceae。不同大花黃牡丹組織內(nèi)生真菌群落豐富度和多樣性不同,其根部內(nèi)生真菌物種最豐富。不同深度根際土壤中真菌具有相似的豐富度與多樣性,根部和根際土壤中真菌群落組成相似。植物組織及根際土壤中的標(biāo)志類群可能具有藥用功能,為大花黃牡丹內(nèi)生真菌和根際真菌的進(jìn)一步研究奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來源】：生物學(xué)雜志. 2020,37(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

稀釋曲線及OTUs韋恩圖分析

對(duì)獲得的大花黃牡丹不同組織內(nèi)生真菌及根際土壤真菌的796個(gè)OTUs進(jìn)行注釋分類,結(jié)果表明不同植物組織中76 239個(gè)序列隸屬于6門13綱(圖2)。子囊菌門(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)是優(yōu)勢(shì)菌門,相對(duì)豐度分別為63.80%～85.30%和10.40%～36.20%。果實(shí)、花、葉中僅有2個(gè)門,即子囊菌門(Ascomycota)和擔(dān)子菌門(Basidiomycota);莖中有3個(gè)門,分別為子囊菌門(Ascomycota,72.20%)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota,27.00%)和被孢霉門(Mortierellomycota,0.70%);根中有6個(gè)門,其中3個(gè)門的相對(duì)豐度≥1%,分別為子囊菌門(Ascomycota,84.50%)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota,10.40%)和被孢霉門(Mortierellomycota,2.40%)[圖2(a)]。在綱水平上隸屬13綱,其相對(duì)豐度≥1%,有10個(gè)綱。根部分布的綱最多,隸屬9綱,其次是莖和葉,隸屬7綱;花和果實(shí)最少,隸屬6綱。圓盤菌綱(Orbiliomycetes)、盤菌綱(Pezizomycetes)和Rozellomycotina是根部特有綱,而傘菌綱(Agaricomycetes)是果實(shí)、花、莖和葉特有綱[圖2(b)]。不同深度根際土壤真菌中44 927個(gè)序列隸屬于7門11綱。子囊菌門(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)是優(yōu)勢(shì)菌門,相對(duì)豐度分別為38.38%～55.70%和22.3%～38.77%;其次是被孢霉門(Mortierellomycota),相對(duì)豐度分別為14.24%～19.76%。在綱水平上隸屬13綱,其相對(duì)豐度≥1%有6綱,分別為Agaricomycetes、Dothideomycetes、Leotiomycetes、Mortierellomycetes、Sordariomycetes 和Tremellomycetes。回盤菌綱(Orbiliomycetes)是上層土壤特有綱,其相對(duì)豐度為0.01%。

為了分析大花黃牡丹不同樣品間真菌多樣性差異,本研究通過Beta多樣性的PCoA (principal coordinate analysis)和 CLC(complete linkage clustering)的分析來闡明不同樣品間多樣性差異。如圖5(a)所示,所有樣品被聚類為兩個(gè)類群(類群1和2),類群1包括莖、葉、花和果實(shí),類群2包括所有不同深度根際土壤樣品和根,結(jié)果表明不同樣品間差異較大,PC1值為32.26%,PC2值為18.66%。CLC分析結(jié)果與PCoA分析結(jié)果[圖5(b)]相似,所有樣品聚類成兩個(gè)類群,類群1(Group 1)包括果實(shí)、花、莖和葉,類群2(Group 2)包括不同深度根際土壤樣品和根。圖5 真菌的群落組成分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]西藏大花黃牡丹根皮揮發(fā)油的提取、成分分析和生物活性研究[D]. 蔣麗麗.黑龍江大學(xué) 2017



本文編號(hào)：3472487