新疆野蘋(píng)果和栽培蘋(píng)果特異性SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)及應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-09-23 08:33
根據(jù)全基因組測(cè)序已完成的栽培蘋(píng)果基因組,設(shè)計(jì)、篩選針對(duì)新疆野蘋(píng)果的特異性SSR引物。通過(guò)PCR擴(kuò)增、基因測(cè)序篩選了15對(duì)可以在新疆野蘋(píng)果和栽培蘋(píng)果中擴(kuò)增出穩(wěn)定性高且具備多態(tài)性目的條帶的特異性SSR引物;其中8對(duì)僅能在栽培蘋(píng)果中擴(kuò)增出特異性目的條帶。15對(duì)特異性SSR引物對(duì)新疆野蘋(píng)果和栽培蘋(píng)果不同居群的SSR分析表明,新疆野蘋(píng)果遺傳多樣性較為豐富,與栽培蘋(píng)果不同居群分化程度較為顯著,基因流水平較低。聚類分析表明,這15對(duì)特異性SSR引物可以將新疆野蘋(píng)果和栽培蘋(píng)果不同居群清晰區(qū)分。本研究利用新開(kāi)發(fā)的SSR引物不僅可以揭示新疆野蘋(píng)果和栽培蘋(píng)果的遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,對(duì)初步了解SSR變異位點(diǎn)的生物學(xué)功能以及豐富新疆野蘋(píng)果和栽培蘋(píng)果基因組的認(rèn)識(shí)也有一定的作用,從而為更好地有效利用相關(guān)資源提供研究基礎(chǔ)。
【文章來(lái)源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(21)
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 樣品調(diào)查采集
1.1.2 試劑和儀器
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 DNA提取
1.2.2 SSR引物設(shè)計(jì)
1.2.3 PCR擴(kuò)增
1.3 數(shù)據(jù)處理和分析
2 結(jié)果與分析
2.1 SSR引物PCR擴(kuò)增分析
2.2 新疆野蘋(píng)果、栽培蘋(píng)果遺傳分化和SSR位點(diǎn)多態(tài)性分析
2.3 新疆野蘋(píng)果和栽培蘋(píng)果系統(tǒng)發(fā)育分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新疆野蘋(píng)果葉形性狀變異及其與SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析[J]. 左力輝,張文林,邱彤,張軍,楊敏生. 園藝學(xué)報(bào). 2015(04)
[2]天山野蘋(píng)果林蘋(píng)果小吉丁與蘋(píng)果腐爛病復(fù)合危害研究[J]. 劉愛(ài)華,張新平,溫俊寶,岳朝陽(yáng),阿里木,焦淑萍,張靜文,克熱曼. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(12)
[3]基于ITS和matK序列探討新疆野蘋(píng)果與中國(guó)蘋(píng)果的系統(tǒng)演化關(guān)系[J]. 朱元娣,曹敏格,許正,王昆,張文. 園藝學(xué)報(bào). 2014(02)
[4]中國(guó)新疆野蘋(píng)果天然群體遺傳多樣性SSR分析[J]. 董研,張軍,任亞超,韓志校. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(05)
[5]新疆野蘋(píng)果資源遺傳多樣性SSR分析[J]. 秦偉,沙紅,劉立強(qiáng),廖康,耿文娟,王云. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2012(02)
[6]新疆蘋(píng)果種質(zhì)資源親緣關(guān)系的SSR分析[J]. 秦偉,劉立強(qiáng),廖康,耿文娟,唐芳. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(01)
[7]天山西部新疆野蘋(píng)果種群特征[J]. 劉華,臧潤(rùn)國(guó),丁易,張煒銀,郭仲軍,白志強(qiáng),劉雙成. 林業(yè)科學(xué). 2010(11)
[8]新疆野蘋(píng)果研究進(jìn)展[J]. 張艷敏,馮濤,張春雨,何天明,張小燕,劉遵春,王艷玲,束懷瑞,陳學(xué)森. 園藝學(xué)報(bào). 2009(03)
[9]新疆野蘋(píng)果群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 張春雨,陳學(xué)森,林群,苑兆和,張紅,張小燕,劉崇祺,吳傳金. 園藝學(xué)報(bào). 2009(01)
[10]新疆發(fā)生蘋(píng)果小吉丁蟲(chóng)[J]. 王春曉,趙健桐,隋建中,趙福,馬福杰. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 1995(05)
博士論文
[1]天山馬鹿種群數(shù)量,遺傳結(jié)構(gòu),家域及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D]. 周璨林.新疆大學(xué) 2015
本文編號(hào):3405387
【文章來(lái)源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(21)
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 樣品調(diào)查采集
1.1.2 試劑和儀器
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 DNA提取
1.2.2 SSR引物設(shè)計(jì)
1.2.3 PCR擴(kuò)增
1.3 數(shù)據(jù)處理和分析
2 結(jié)果與分析
2.1 SSR引物PCR擴(kuò)增分析
2.2 新疆野蘋(píng)果、栽培蘋(píng)果遺傳分化和SSR位點(diǎn)多態(tài)性分析
2.3 新疆野蘋(píng)果和栽培蘋(píng)果系統(tǒng)發(fā)育分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新疆野蘋(píng)果葉形性狀變異及其與SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析[J]. 左力輝,張文林,邱彤,張軍,楊敏生. 園藝學(xué)報(bào). 2015(04)
[2]天山野蘋(píng)果林蘋(píng)果小吉丁與蘋(píng)果腐爛病復(fù)合危害研究[J]. 劉愛(ài)華,張新平,溫俊寶,岳朝陽(yáng),阿里木,焦淑萍,張靜文,克熱曼. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(12)
[3]基于ITS和matK序列探討新疆野蘋(píng)果與中國(guó)蘋(píng)果的系統(tǒng)演化關(guān)系[J]. 朱元娣,曹敏格,許正,王昆,張文. 園藝學(xué)報(bào). 2014(02)
[4]中國(guó)新疆野蘋(píng)果天然群體遺傳多樣性SSR分析[J]. 董研,張軍,任亞超,韓志校. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(05)
[5]新疆野蘋(píng)果資源遺傳多樣性SSR分析[J]. 秦偉,沙紅,劉立強(qiáng),廖康,耿文娟,王云. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2012(02)
[6]新疆蘋(píng)果種質(zhì)資源親緣關(guān)系的SSR分析[J]. 秦偉,劉立強(qiáng),廖康,耿文娟,唐芳. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(01)
[7]天山西部新疆野蘋(píng)果種群特征[J]. 劉華,臧潤(rùn)國(guó),丁易,張煒銀,郭仲軍,白志強(qiáng),劉雙成. 林業(yè)科學(xué). 2010(11)
[8]新疆野蘋(píng)果研究進(jìn)展[J]. 張艷敏,馮濤,張春雨,何天明,張小燕,劉遵春,王艷玲,束懷瑞,陳學(xué)森. 園藝學(xué)報(bào). 2009(03)
[9]新疆野蘋(píng)果群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 張春雨,陳學(xué)森,林群,苑兆和,張紅,張小燕,劉崇祺,吳傳金. 園藝學(xué)報(bào). 2009(01)
[10]新疆發(fā)生蘋(píng)果小吉丁蟲(chóng)[J]. 王春曉,趙健桐,隋建中,趙福,馬福杰. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 1995(05)
博士論文
[1]天山馬鹿種群數(shù)量,遺傳結(jié)構(gòu),家域及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D]. 周璨林.新疆大學(xué) 2015
本文編號(hào):3405387
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