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狹葉柴胡β-amyrin合成酶基因的克隆及其蛋白的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2023-11-12 17:50
  【目的】本文擬獲得β-amyrin合成酶基因的全長序列及其蛋白的生物學(xué)信息!痉椒ā恳元M葉柴胡為材料,獲得了抗肝炎有效成分齊墩果酸合成關(guān)鍵酶—β-amyrin合成酶基因的cDNA序列,并應(yīng)用生物信息數(shù)據(jù)庫(哪個(gè)數(shù)據(jù)庫)和分析軟件(交代分析軟件的類型)對(duì)該基因的保守序列、蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、跨膜結(jié)構(gòu)域、亞細(xì)胞定位、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)、磷酸化位點(diǎn)做了分析!窘Y(jié)果】β-amyrin合成酶基因的ORF核苷酸長度2289 bp,編碼762個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)序列中含有氧化鯊烯環(huán)化酶家族所特有的且高度保守的DCTAE、QW和MWCYCR 3個(gè)序列;BsAS無跨膜區(qū),為親水性蛋白,定位于細(xì)胞質(zhì)中;其二級(jí)結(jié)構(gòu)主要為α-螺旋和無規(guī)卷曲,三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果可信。狹葉柴胡BsAS蛋白共有53個(gè)磷酸化位點(diǎn),其中絲氨酸的磷酸化位點(diǎn)最多。【結(jié)論】本研究首次在狹葉柴胡中克隆了BsAS全長基因,同時(shí)利用生物信息學(xué)分析了其蛋白特性及細(xì)胞定位,該研究豐富了BsAS基因資源庫,同時(shí)為齊墩果烷型代謝產(chǎn)物及代謝途徑的深入研究奠定基礎(chǔ)。

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 供試材料
    1.2 試劑
    1.3 試驗(yàn)方法
        1.3.1 BsAS全長序列擴(kuò)增
            (1) BsAS基因中間片段的擴(kuò)增。
            (2)BsAS基因5’端片段的擴(kuò)增。
            (3)BsAS基因3’端片段的擴(kuò)增。
            (4)BsAS全長基因的擴(kuò)增。
        1.3.2 BsAS序列生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 狹葉柴胡中β-amyrin合成酶基因BsAS的克隆
    2.2 狹葉柴胡BsAS基因生物信息學(xué)分析
        2.2.1 BsAS保守序列分析
        2.2.2 狹葉柴胡BsAS理化性質(zhì)分析
        2.2.3 狹葉柴胡BsAS跨膜區(qū)、亞細(xì)胞定位分析
        2.2.4 狹葉柴胡BsAS二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測
        2.2.5 狹葉柴胡BsAS三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測
        2.2.6 狹葉柴胡BsAS磷酸化位點(diǎn)預(yù)測
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號(hào):3863646

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