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基于SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)構(gòu)建割手密核心種質(zhì)庫

發(fā)布時間:2023-08-06 12:20
  以92份割手密初級核心種質(zhì)為研究對象,利用SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù),依據(jù)Jaccard、SM和Nei&Li 3種遺傳相似性系數(shù)逐步進(jìn)行UPGMA聚類、多次抽樣構(gòu)建割手密核心種質(zhì)庫。結(jié)果顯示:92份樣本在15個SSR位點上呈現(xiàn)出豐富的多態(tài)性,共獲得331個多態(tài)性條帶,平均多態(tài)性條帶比例達(dá)100%;利用3種遺傳相似性系數(shù)和隨機(jī)取樣共獲得5個核心種質(zhì)庫;Shannon–Wiener多樣性指數(shù)、總條帶數(shù)和多態(tài)性條帶數(shù)3個指標(biāo)在核心種質(zhì)庫代表性檢驗中呈現(xiàn)出較高的檢測效率,其他6個指標(biāo)檢測效率相對較低;5個核心庫中依據(jù)SM遺傳相似性系數(shù)逐步構(gòu)建的核心種質(zhì)庫質(zhì)量最優(yōu),該庫由80份樣本組成,Nei’s多樣性指數(shù)和Shannon-Wiener多樣性指數(shù)分別為0.984 1和4.259 8,在P<0.05概率條件下與原庫(分別為0.985 6和4.358 3)無顯著差異,而且與原庫的農(nóng)藝性狀均值差異百分率為0(<20.00%),極差符合率為99.16%(>80.00%)。研究認(rèn)為,依據(jù)SM相似性系數(shù),通過UPGMA聚類構(gòu)建的80份割手密核心種質(zhì)較好地代表了基礎(chǔ)原始種質(zhì)的分子水平和表型遺...

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 葉片基因組總DNA提取與PCR擴(kuò)增
        1.2.2 分子標(biāo)記數(shù)據(jù)統(tǒng)計
        1.2.3 取樣策略
2 結(jié)果與分析
    2.1 初級核心種質(zhì)的遺傳多樣性
    2.2 核心種質(zhì)的取樣策略
    2.3 核心種質(zhì)的代表性檢測
3 結(jié)論與討論



本文編號:3839410

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