苗藥八爪金龍基原植物DNA條型碼的篩選與鑒定
發(fā)布時(shí)間:2023-04-29 22:37
八爪金龍屬紫金?(Myrsinaceae)紫金牛屬(Ardisia)植物,是常用民族藥,其抗病毒、抗心律失常、抗腫瘤的效果顯著。八爪金龍的基原植物表型極度相似,導(dǎo)致其應(yīng)用混亂。本研究篩選適用于八爪金龍基原植物鑒定的DNA條形碼序列,以探索高效準(zhǔn)確鑒定八爪金龍基原植物的新方法。提取了百兩金、朱砂根和紅涼傘的植物基因組DNA,利用DNA條形碼序列(ITS, ITS2, RbcL, PsbA-trnH)對其進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序,比較各序列的擴(kuò)增率和測序率,應(yīng)用Blast方法來評估各序列的鑒定效率。同時(shí)與9種紫金牛屬植物的相應(yīng)序列進(jìn)行比對,構(gòu)建NJ樹。結(jié)果表明:ITS、ITS2、RbcL序列的擴(kuò)增成功率和測序成功率均為100%,PsbA-trnH序列的擴(kuò)增成功率和測序成功率分別為97.7%和96.7%。4個(gè)候選序列的BLAST成功率結(jié)果:ITS=ITS2 (100%)>PsbA-trnH (99.2%)>RbcL (33.3%)。ITS序列的平均種間遺傳距離大于平均種內(nèi)遺傳距離。系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建結(jié)果顯示,ITS2序列的NJ樹可將百兩金、朱砂根和紅涼傘單聚成一支,與同屬植物區(qū)別開;P...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 四種候選DNA條形碼序列的初評估
1.2 四條候選序列的遺傳距離分析
1.3 八爪金龍的RbcL序列數(shù)據(jù)分析
1.4 八爪金龍的ITS2序列數(shù)據(jù)分析
1.5 八爪金龍的PsbA-trnH序列數(shù)據(jù)分析
1.6 八爪金龍的ITS序列數(shù)據(jù)分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 八爪金龍的DNA提取、擴(kuò)增
3.2 PCR產(chǎn)物的電泳及測序、數(shù)據(jù)處理
本文編號:3805880
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1 結(jié)果與分析
1.1 四種候選DNA條形碼序列的初評估
1.2 四條候選序列的遺傳距離分析
1.3 八爪金龍的RbcL序列數(shù)據(jù)分析
1.4 八爪金龍的ITS2序列數(shù)據(jù)分析
1.5 八爪金龍的PsbA-trnH序列數(shù)據(jù)分析
1.6 八爪金龍的ITS序列數(shù)據(jù)分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 八爪金龍的DNA提取、擴(kuò)增
3.2 PCR產(chǎn)物的電泳及測序、數(shù)據(jù)處理
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