以花生（Arachis hypogaea Linn.）品種‘Florunner’為研究對(duì)象,利用RNA-seq技術(shù)對(duì)花生異型雄蕊進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序;在此基礎(chǔ)上,運(yùn)用Nr、KOG、GO和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行同源序列比對(duì)和基因功能分析。結(jié)果顯示:花生異型雄蕊轉(zhuǎn)錄組測(cè)序共獲得數(shù)據(jù)量約31.46 G,其中,clean reads所占比例均在96.0%以上;經(jīng)過(guò)組裝和拼接后得到197 193個(gè)contigs,片段總長(zhǎng)度240 463 900 bp,最長(zhǎng)片段為15 810 bp,非冗余unigenes片段的平均長(zhǎng)度為1 219 bp,GC含量為39.1%,片段長(zhǎng)度N50為1 966 bp;長(zhǎng)度大于等于1 000 bp的unigenes占unigenes總數(shù)的43.4%,表明組裝完整性較高,可用于注釋分析。與Nr數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì)結(jié)果顯示:共有129 223個(gè)unigenes注釋到Nr數(shù)據(jù)庫(kù),占unigenes總數(shù)的65.5%;其中,1×10^-100<E≤1×10^-5的unigenes占54.2%,說(shuō)明注釋的unigenes序列與Nr數(shù)據(jù)庫(kù)的同源序列具有高度相似... 

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 總RNA的提取和檢測(cè)
        1.2.2 文庫(kù)制備和測(cè)序
        1.2.3 原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和功能注釋
2 結(jié)果和分析
    2.1 測(cè)序結(jié)果和數(shù)據(jù)組裝結(jié)果分析
    2.2 unigenes功能注釋分析
        2.2.1 序列相似性分析
        2.2.2 KOG功能分析
        2.2.3 GO功能分析
        2.2.4 KEGG代謝通路分析
3 討論和結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[4]異型雄蕊的研究進(jìn)展[J]. 羅中萊,張奠湘.  熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào). 2005(06)
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本文編號(hào)：3649044