薔薇科桃屬植物長(zhǎng)柄扁桃Amygdalus pedunculataPall.是我國(guó)重點(diǎn)發(fā)展的12種木本油料作物之一。將自然生長(zhǎng)在陜西省榆林市毛烏素沙地的長(zhǎng)柄扁桃進(jìn)行高通量測(cè)序、組裝得到了GenBank登錄號(hào)為MG602257的長(zhǎng)柄扁桃葉綠體基因組。與NCBI中其他兩個(gè)長(zhǎng)柄扁桃葉綠體基因組（MG869261和KY101153）進(jìn)行序列比對(duì)發(fā)現(xiàn):長(zhǎng)柄扁桃葉綠體基因組均呈現(xiàn)典型的4分區(qū)域結(jié)構(gòu);基因組序列GC含量均是36.8%;總長(zhǎng)度MG602257<MG869261<KY101153,分別為157 851 bp、157 873 bp和157 948 bp;3個(gè)葉綠體基因組存在149個(gè)突變位點(diǎn),包括93次替換事件、56次插入缺失事件、無(wú)小倒位事件。長(zhǎng)柄扁桃葉綠體基因組密碼子數(shù)目和RSCU值偏性分析具有極高的相似性。3個(gè)長(zhǎng)柄扁桃葉綠體基因組在JLB/JSB/JSA/JLA四個(gè)邊界有相同的基因類型和排列順序,但在LSC/IRa邊界JSA中,ndhF基因在MG602257和MG869261中的總長(zhǎng)度相同,而在KY101153中總長(zhǎng)度增加9bp;ycf1基因橫跨IRb/SSC邊界區(qū),基因長(zhǎng)度... 

【文章來(lái)源】：生物工程學(xué)報(bào). 2020,36(12)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【部分圖文】：

長(zhǎng)柄扁桃的葉綠體基因組不同序列插入缺失事件分布情況

長(zhǎng)柄扁桃的葉綠體基因組插入缺失類型與數(shù)目

長(zhǎng)柄扁桃和同屬物種榆葉梅是多倍體植物，分類地位一直有爭(zhēng)議[41-44]。在分子系統(tǒng)學(xué)中，高等植物葉綠體基因是研究植物分類中可依賴的材料。為闡明長(zhǎng)柄扁桃在扁桃亞屬上的系統(tǒng)進(jìn)化位置和與近緣種的親緣關(guān)系，本研究選取NCBI中全部已有的長(zhǎng)柄扁桃葉綠體基因組，加上已公布的共9個(gè)物種的13條葉綠體基因組序列為研究對(duì)象構(gòu)建進(jìn)化樹。選取的植物物種葉綠體基因組具體情況如表2所示。以MEGA5.5和Geneious軟件構(gòu)建NJ進(jìn)化樹如圖8所示。圖8中結(jié)果顯示長(zhǎng)柄扁桃MG602257、MG869261和KY101153三條序列聚為一支，KY101153與榆葉梅聚為一小支，顯示長(zhǎng)柄扁桃和榆葉梅親緣關(guān)系相近，研究結(jié)果與董山平等學(xué)者結(jié)論一致[4,41-44]。圖7 長(zhǎng)柄扁桃葉綠體基因組密碼子的RSCU值對(duì)比

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于全基因組從頭測(cè)序技術(shù)鹽膚木葉綠體基因組的測(cè)序分析[J]. 左瑞華,蔣平,孫傳伯,陳存武,婁新建.  生物工程學(xué)報(bào). 2020(04)
[2]木部類、果部類和草部類藥食同源中藥安全性評(píng)價(jià)研究進(jìn)展[J]. 吳玲,鄭琴,張科楠,羅俊,郭園園,吳海霞,肖帥,李文靜.  中草藥. 2019(10)
[3]沙地瀕危植物長(zhǎng)柄扁桃生物學(xué)特性與抗逆性及應(yīng)用綜述[J]. 黃來(lái)明,邵明安,裴艷武,張應(yīng)龍.  土壤. 2019(02)
[4]中藥郁李仁本草考證及化學(xué)成分研究[J]. 劉星劼,張永清,李佳.  遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(12)
[5]榆葉梅及其部分近緣種的染色體核型分析[J]. 董山平,羅樂,鐘軍珺,程堂仁,張啟翔.  西北植物學(xué)報(bào). 2015(03)
[6]中國(guó)扁桃亞屬植物親緣關(guān)系及其演化途徑研究[J]. 邱蓉,程中平,王章利.  園藝學(xué)報(bào). 2012(02)
[7]黃粉蟲油對(duì)高脂血癥小鼠血脂水平及抗氧化能力的影響[J]. 張建新,張立佳,王臨賓,林福壁,朱杰.  食品科學(xué). 2011(05)
[8]長(zhǎng)柄扁桃油脂肪酸成分分析[J]. 李聰,李國(guó)平,陳俏,白斌,申燁華,張應(yīng)龍.  中國(guó)油脂. 2010(04)
[9]蘋果籽油對(duì)實(shí)驗(yàn)性高脂血癥大鼠的防治作用[J]. 趙雁武,仇農(nóng)學(xué),高霞,王多寧,楊穎.  第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(06)
[10]葉綠體基因組研究進(jìn)展[J]. 邢少辰,CLARKE JIHONG LIU.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2008(01)

碩士論文
[1]基于染色體核型和單拷貝核基因DNA序列的榆葉梅及其近緣種系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 董山平.北京林業(yè)大學(xué) 2015
[2]毛櫻桃資源遺傳多樣性及與李屬近緣種親緣關(guān)系的研究[D]. 張琪靜.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3623914